Intronであるための必要条件

質問

ある論文で,Intronはgtで始まり,agで終了するというruleがあると書かれていました.
このrule以外に,Intronであるための必要条件は存在するのでしょうか?

回答No.2

geneticist12 · ベストアンサー

たとえば、
http://www.pubmedcentral.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pubmedid=7063411
http://www.pubmedcentral.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pubmedid=1508718
http://www.pubmedcentral.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pubmedid=6246511
など。

PubMed
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed
で、"RNA splicing consensus"などのキーワードで検索をすると、もっといろいろ関連する論文が出てきます（結論は似たりよったりですが）

回答No.1

geneticist12

GT-AG ruleは、特殊な調節的alternative splicingがあるような場合を除いて例外はほとんどありません。そのほかには、絶対にこうというのはないようです。しかし、統計的に頻度の高い塩基を調査してconsensusを導きだした研究はいくつかあります。生物種を限定するとconsensusがすこし偏ったりしますが、全生物を対象としたconsensusを手元にある論文２編からそれぞれ引き写すと

mag|GTragt-----------yyyyyynyAG|gk

mag|GTragt-------tyyyyyyyyyncAG|g

|: exon-intron junction
k: g or t
m: a or c
n: any
r: a or g
y: c or t

小文字であらわしたconsensusに一致する頻度は、それぞれの塩基について、6割程度から9割程度までです。

お礼

ご回答ありがとうございます.
もし,可能であれば参照された2論文のタイトル,著者などの情報をお教え願えないでしょうか？