確定申告後の源泉について

質問

個人事業主です。
数社と取引があり、報酬振込時に報酬料金に係る源泉所得税の処理をしてくれる所と、しない所があります。数年前、後者に源泉依頼をしたのですが「何年もこれでやって来ている。税務署に言われてないのに、する必要はない。」という回答でした。
確定申告を終え、ほっとしている３月初旬、その会社からこんな文書が届きました。
『１月下旬に税務署の源泉所得税調査が入り、２月下旬付けで平成２０年分の源泉徴収をする旨の指導がありました。計算書（税務署作成）を添付しますので、確認のうえ、確定申告また当社への源泉税の支払いをお願いいたします。３月上旬に源泉税は当社が立替払いしました。支払調書を同封しますので、確定申告をお願いします。立て替えた源泉税については、今月下旬の支払分より充当するか、振込していただくか、後日改めてご相談いたします。』
源泉税額は１万数千円です。私は振込みをさせていただきたいと考えています。今後私はどう動くのがベストでしょうか？
青色申告会に入っていて、申告書類はそちらから税理士さんのチェック後、税務署に行きます。まだ担当者の手元に書類があり、税務署には届いていませんが、昨年１２月で決算し申告していることですから、今さら直しようがないですよね。青色申告会に相談しようと電話しましたが、一般の申告相談でてんてこ舞いで、担当者につないでもらえませんでした。　なるべく面倒なことはしたくないというのが本音でありますが、ひとまずこのまま申告をして、３月下旬に源泉税の立替ていただいた分を振り込んでから、修正申告をすればよいのでしょうか。何か延滞金のようなものが発生しますか？勉強不足で申し訳ありませんが、アドバイスをお願いいたします。

回答No.1

minosennin · ベストアンサー

方法は次の二つにひとつでしょう。

１．今回の申告書を訂正する。
申告書の源泉徴収税額欄を訂正するだけですから、担当者がその気になれば簡単にやれるはずです。電話をつないでくれないのなら、青色申告会にＦＡＸでその届いた支払調書と文書、それにいきさつを書いたメモを送るなりして、担当者に渡すよう依頼されてはいかがでしょうか。

２．確定申告後、更正の請求をする。(１．が間に合わない場合の対策です。)
申告書に記載された源泉徴収税額が過小だったのですから、納付税額が過大(又は還付税額が過小)で、税金が戻ることになります。この場合は修正申告でなく、更正の請求を行います。期限は確定申告期限から１年間です。

なお、税金が戻るケースですから、延滞金等はありません。

お礼

minosenninさま、早速にありがとうございました。
今、青色申告会にファックス連絡し終えたところです。担当者さんからの連絡を待ってみます。
更正請求など、勉強になり助かりました。本当にありがとうございました。