プライマーについて

質問

PCRについて初心者です。DNAオリゴプライマーというのがありますが、これは　一般に言われる　プライマーとは違うものなのでしょうか??また、どんな時に　DNAオリゴプライマーを使用すればよいのでしょうか？よろしくお願いします。

回答No.2

tuba · ベストアンサー

ＰＣＲに関して言えば、同じ意味だと思われます。
Taqポリメラーゼ等のごく一般的な酵素を使うＰＣＲでは、
Ｔｍをエクステンション温度より低くしなければならないので
プライマーの鎖長はおよそ２０mer前後です。
この２０mer前後をオリゴマーというべきかどうか議論があるところですが、
ＤＮＡ合成機（アミダイト法）で合成できるもの（鎖長２から１２０くらいまで）を
ＤＮＡオリゴマーと呼ぶのが一般的なようです。
すなわち、ＰＣＲに使うプライマー　＝　ＤＮＡオリゴプライマーです。

お礼

ありがとうございます。プライマーにはいろいろな　言い方があるのですね。

回答No.4

nitscape

#2と同意見です。
DNAオリゴプライマーは一般に言うプライマーのことです。

一般的に短いものを「オリゴマー」と呼びます。例えばアミノ酸がたくさんつながったポリペプチドの短いものをオリゴペプチドと呼んだりもしますよね。つまりオリゴペプチド＝ポリペプチドです。しかしポリペプチド＝オリゴペプチドかと言うと厳密には違います。長いポリペプチドはオリゴペプチドとは呼ばないからです。

ここからは補足です
DNAオリゴプライマーに対して"長い"プライマーはと言うと．．．その1つに「メガプライマー」というものがあります。これはメガプライマー法での第一段PCRで得られるプライマーのことです。このPCR方法は突然変異を導入したい位置の近くに制限酵素サイトがない（作れない）ときに用いることがあるものです。

お礼

どうもありがとうございます。参考になりました。

回答No.3

tokyobayfighter

1です。
もし、その二つが使い分けれているとしたら、
PCRなどで使う合成DNAのプライマーを
「DNAオリゴプライマー」と呼んで、

生体内で作られているプライマーを
「プライマー」と呼んでいるのかな？

お礼

ありがとうございます。

回答No.1

tokyobayfighter

同じではないですか？