生検組織からの細菌DNA抽出の方法

質問

生検組織（腸粘膜組織）から細菌（グラム陽性菌、グラム陰性菌）のゲノムDNAを抽出したいと考えています。グラム陽性菌は他のほ乳類等に比べて抽出が困難であったと思います。できればキットがあればありがたいのですが、ご存知であれば教えて下さい。ちなみに得られたDNAは、菌のPCR検出に使用予定です。

回答No.2

rio2

標的によるとも思いますが、
１．検体まるごとホモジナイズorビーズビーター。
２．組織の洗浄液から抽出操作。
３．抽出では、目的に応じてライゾザイム、ザイモライエース、プロテイネースなどの酵素を用いたり、フェノールやグアニジンなどのタンパク変性剤と組み合わせたりと行う方法があります。
効率が悪いものは、１割とか２割とか程度のDNA回収率だといわれています。

回答No.1

Kunishige

こんばんは。

菌液をソニケーションして、エタ沈するって方法じゃダメなの？

補足

申し訳ありません。説明不足だったかもしれません。
生検組織に感染している菌の有無を検出するのが目的です。
ほ乳類組織からDNAを抽出するキットは存在しますが、それはだいたい菌を対象としたものではなさそうなのです。

ですから、菌液は存在いたしません。