分散分析の主効果について

質問

現在anova4により分散分析を行っています。

今回の質問は、１要因３水準の場合です。
（ここでは、要因をA、水準をa,b,cの再生率とさせてください）
分析結果として、要因の主効果が有意だったので、
「水準間に差があるのか～」
と思って画面をスクロールさせていくと、
下位検定でライアン法による多重比較の結果は、
水準間の差のところはすべて(n.s.)と表示されていました。

このような場合、どう考察すべきなのでしょうか？
私はてっきり、
「Aと言う要因の元で再生を行った場合、a,b,cの再生率に差が出る」
と言うような感覚で考えていましたが、
今回の場合はそれでは無理なようです。

また今回の下位検定では、
有意水準p=0.05で行っているのに、
p=0.0216613と言う値が提示されているところも（n.s.）でした。
これも何か重要なことなのでしょうか？

どうぞよろしくお願いします。

回答No.1

orrorin · ベストアンサー

統計学的にどうこうということまではわかりませんが、自身の経験則に照らして言うならば、主効果が有意で多重比較は有意ではないということはままあります。
特に二次線形成分有意とかだと、そういうことになりやすいんじゃないでしょうか。

考察は主効果有意だけで話を進めれば大丈夫です。
全体としては、その要因はちゃんと再生率に影響を与えているのですから。
少し乱暴な言い方になりますが、水準で切り分ける場所が悪かったのだと思ってください。
それよりはパタンが仮説に沿っているかの方がよほど重要です。

>「Aと言う要因の元で再生を行った場合、a,b,cの再生率に差が出る」
分散分析はもともと「三つ以上の差」という日本語的にはよくわからないものを対象としているので、違和感があるのだと思います。
「Ａの主効果は有意であった。すなわちＡにより再生率が変化した」とかでいいんじゃないでしょうか。

二つ目の質問について、私はanova4を使ったことがないのでわかりませんが、そこでは普通にt分布から算出したp値を表示して、有意かどうかの判定は修正した有意水準で行っているという可能性はないでしょうか。
ご承知のように同精度のｔ検定と多重比較では後者のほうが若干厳しめの値が必要になります。

まぁ非使用者の私がどうこういってもしょうがなく、かつプログラムの作成者がはっきりしているので、この機に確認してみることをお勧めします。

お礼

返事及びお礼が遅くなり申し訳ありませんでした。

回答していただいた内容を参考にし、
無事課題を完了することができました。
ありがとうございました。