電気泳動に至るまでの操作で

質問

初心者です。

　ＲＮＡを精製して
　変性ゲルで電気泳動をかける前に
　Ｄｙｅを入れます。
　４℃の冷蔵室で約90分電気泳動すると
　ちょうど良いと教えられました。

　時間ではなくてＤｙｅ で判定する意味というか
　目安をお教えください。

　ゲルは１．５パーセント
　添加するＲＮＡ濃度は１μg/μlに調整しています。
　電気泳動数分後みると　バンドが三つ見えます。
　この最後の三つ目が真ん中に来るくらいで止めるとの
　ことですが、その意味がよく分かりません。

回答No.1

tunertune · ベストアンサー

＞この最後の三つ目が真ん中に来るくらいで止める

そのくらいがちょうど目的のサイズがきれいに見えるという意味だと思います。

＞時間ではなくてＤｙｅ で判定する意味

もし時間ではかっていると、電圧が低かったりして泳動があまり進んでいなかった場合にみにくい状態で泳動を止めることになります。一方、Dyeが移動していれば泳動はきちんと進んでいることになります。まあ、いつも同じようにやるのなら時間ではかってもあまりブレないのかもしれませんが、Dyeの位置も確認した方がいいんじゃないでしょうか。

お礼

ありがとうございます！

Ｄｙｅの位置で判定するのは分かるのですが
見やすい位置って人によって違っていて
それによって5～10分くらい差があるのです。
そこが悩むところ・・