Blastについて

質問

Blast検索では、スコアが高く、かつ、期待値が0に近い程、偶然でなく、相同性が高いという解釈だと思いますが、期待値が負の値(例えば、E-134等)になる場合は、どういうことを表しているのでしょうか。

回答No.2

miya_0726 · ベストアンサー

http://mikilab.doshisha.ac.jp/dia/research/report/2003/0608/006/report20030608006.html

ここの3.3をご覧ください。
E valueの計算方法が載っています。
Eは間違いで、表記としてはeが正しく、これは自然対数の底です。
E valueは指数的に変化するものなので、eであることはそれほど重要ではないですが・・・。

お礼

度々ご回答ありがとうございます。

早速拝見しましたが、よくわかりませんでした。

ただ限りなく０に近いということがわかりましたので、

非常に助かりました。

ありがとうございました。

回答No.1

miya_0726

いや、E-134は負の値じゃないですから・・・。
E-134はあくまで（1/E^134）です。
Eの134乗分の1です。これ、正の値ですよね？

E-100よりもE-134のほうが、偶然でなく相同性が高い、という解釈をします。

お礼

早速のご回答ありがとうございます。

では、限りなく0に近いということですね。

ところでEってなんでしたか。