エチジウムブロマイドに関する疑問

質問

エチジウムブロマイドは2本鎖DNAにインターカレートし、UVを当てると…

では1本鎖であるとされるRNAはなぜエチジウムブロマイドで検出できるのでしょうか？
部分的に2本鎖を形成している以外で、何かお答えお願いします。

回答No.1

geneticist12

＞部分的に2本鎖を形成している

それが正解だと考えていいでしょう。
RNAはDNAより、ずっとずっと染まりが悪いです。
Northernなど、変性条件で水素結合を解いたRNAは、ゲルから変性剤を除かないとほとんど染まりません。

核酸にEtBrがくっつく力としては静電気力（EtBrが＋、核酸が－）がありますが、intercalateした場合のように強い蛍光は出せません。