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tm値とGC含量
DNAのTm値とGC含量にはどのような関係があるのですか?Tm値が高いとGC含量も高いとか、そのようなことがいえるのでしょうか?
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DNA二重らせんにおいて、相補鎖間のA-T間の水素結合は二本ですが、G-C間では水素結合が三本形成されます。そのためG-C間の結合はA-T間と比較して安定で、GC含量が多いDNAはTm値が高くなる傾向があります。
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- geneticist12
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回答No.2
GC含量、DNAの長さをパラメーターにTmを近似する計算法はいろいろありますが、オリゴヌクレオチドの場合、最も簡単な方法では、GCのペア1対あたり4度、TAペア1対あたり2度として足し算します。
補足
ありがとうございます。 では、Tm値が何℃くらいだと高い(=GC含量多い)などという基準はあるのですか?ちなみに、94℃というのは高すぎるのでしょうか?それとも一概に言えないのでしょうか?