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人間の全塩基配列の取得を取得したいのですが.
最近,分子生物学の素人の者です.宜しくお願いします. 今,人間の染色体毎の塩基配列を取得したいのですが, インターネット上に公開されているのでしょうか? 知人にNCBIのサイトで取得できる可能性を教えてもらったのですが,よく使い方がわかりませんでした. どなたかご教授願います.
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まず、質問の意図なのですが、全配列ということでいいのでしょうか？↓の方の紹介されてるMapViewは遺伝子のポジションや遺伝子配列等を知るには使えるのですが、全配列を欲しいのでしたらncbiのftpサイトからダウンロードすることが出来ます。ただ、染色体ごとに一ファイルにされているもののcontig毎に分かれているので、もし配列を使って計算処理をされるのでしたら、その辺は考慮しないといけないですが。
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- Noy
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#1です。補足です。 例えば血友病(hemophilia)の塩基配列を見たければ、関連遺伝子は、性染色体(X)上にありますので、トップページのX染色体をクリック、その後、hemophilia(coagulation factor VIII, procoagulant component (hemophilia A))の「sv」とあるところをクリックします。すると、 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NT_025307.15&from=392718&to=942235&view=graph&_gene=F8 が表示されます。
- Noy
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以前、高校の生物の授業で使用しました！このプリント、もってます！このサイトからうちの先生は取ってたんだ！とてもおもしろいサイトですね。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/map_search.cgi?taxid=9606 どうぞ。
