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遺伝子座の表示の仕方について
NCBIなどで、調べた遺伝子の染色体上に配置が表示されますが、4q25.3-4q28 などの表示の仕方の意味がいまいち分からず、2つほど質問させて下さい。 (1)4は、染色体の4番目を示しているのは、分かるのですが、その後の25.3-28 は、25.3bpから28bpという意味ですか?少数点で、塩基の番号が中途半端なのがよく分かりません。 (2)pやqは、染色体上の動原体より上をp、下をq というのでしょうか? なんの略なのでしょうか? よろしくお願いします。
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染色体を決まった方法(ギムザ染色)で染色したときに、決まったパターンで観察されるバンドをもとにして、染色体上の位置を表す方法です。 4q25.3なら、第4染色体のq腕(長腕。動原体から伸びる長い方の腕がq、短い方がp)の25番のバンドということです。バンドは観察精度や要求される精度によって細分化されます。さらにバンドを細分化する場合は小数点以下の数字で表します。 染色体バンドのマップ表記のルールは生物種によってことなります。お調べになっているのはヒトの遺伝子のようですね。 http://www.microbes.jp/rika/rika_no19/rika_no19.htm#sensyokutai の図10 ヒト染色体分染パターンの模式図を見てください。
お礼
早いご回答、本当にありがとうございました。サイトで、ずっと遺伝子座表現法、染色体地図、などのキーワードで検索していても見つからなかったのです。とても参考になりました。ありがとうございました。