微生物の分類について

質問

微生物の分類について
微生物の分類をする際のスタンダードは16SrRNA遺伝子配列だと思うのですが、最も信頼できる（新種提唱などの決め手になる）分類法はなにになるのでしょうか。
もちろん、新種提唱などの細かい分類をするときには、遺伝子型や、表現型などの複数の試験を行い、それらを組み合わせるというのはわかるのですが、たとえば、以前はおそらくDNA-DNA交雑形成が菌同士の比較でかなり大きな決め手になっていたと思います。いまは交雑形成ではなく別のものが使われているという話も聞いているのでが、どうなのでしょうか？
これらのことについて、最新の情報をご存知の方や、それらのことを勉強するのに適した論文やサイトについてご存知の方、教えてください。

回答No.1

kazu-nori · ベストアンサー

細菌に関しては参照URLで
keywordsを　minimal standard taxa　で検索した文献を参照してください。
（必要に応じてkeywordsは追加してください）

他の微生物（真菌など）については詳しくないのですが，
新種の提案がよくされている雑誌で，個々の論文を確認されたほうが良いと思います。

個人的には遺伝子配列のみでの分類が進みすぎるのはいかがなものかと感じています。
現在名前のついている微生物は，地球全体の中ではごく少数です。
16SrDNAの遺伝子配列が何％違うからこれ新種！というのは，なんだかなーと（属レベルで十分）。
その菌の独自性・有用性・危害性などで重視して判断したほうが良いと思ってます。

参考URL：

http://ijs.sgmjournals.org/

お礼

お礼が遅れてしまって申し訳ありませんでした。
たしかにminimal standardが重要になりますね。
今のスタンダードとして16Sを考えてしまいますが、最もな意見だと感じました。
ありがとうございました。