細菌を新しく提唱するときに必要な分類試験

質問

たとえば、IJSEMにバクテリアを新種として発表するとき、もしくは別の論文で新しい種類の細菌として登録し、Validation Lists of　Bacterial Namesに別刷で登録してもらう場合、その細菌が新種であることを証明するための試験は、何について行えばいいのでしょうか。

遺伝子学的に交雑形成試験や16SrRNA遺伝子解析、生理学的にグラム陰性陽性など、色々とあると思うのですが、これについてはIJSEMが定めた「最低限これについては試験をしておかないといけない」という基準があるはずだと聞きました。
そこで自分で少し調べたつもりなのですが、具体的な記述を見つける事が出来ませんでした。
菌の門や、類縁種などによって違うのかもしれませんが、そのあたりについてもよくわかっていません。

詳しい方のご意見を伺いたいと思っております。
ご存知の方、ご教授をお願い致します。

回答No.1

prumin · ベストアンサー

分類群ごとに違うはずです。

ただ，質問者さんがやるべきことはシンプルで，
近縁種（可能であれば同属と考えている種）の新種記載論文を熟読しましょう。
minimal standards（「最低限これについては試験をしておかないといけない」という基準）が決まっている分類群ならばそれについて言及があるはずで，そこから文献をたどれるでしょう。
近縁種の検討がつかないのであれば近縁種の見当をつけるのが先です。
あるいは全くの新門ということであれば，Gematimonadetes 門の記載などが 2003 年にありましたので，参考になると思います。

特にルールがない場合でも，近縁種の記載時に調べられていることは最低限比較するべきであり，記載が古い種については最新の Bergey's Manual での記載項目を比較する必要もあると思います。

お礼

ありがとうございます。
新種記載論文等には目を通していたのですが、それとは別にIJSEMが設定するMinimal standardがあるときいており、それについて知りたいとおもっていました。pruminさまのお話を聞く限りそういうものは決まっていないと考えるのが良いようですね。
ご回答ありがとうございました。

回答No.2

prumin

誤解を与えてしまったかもしれませんので，補足いたします。
まず，原核生物の学名を記載するルールは IJSEM ではなく，International Code of Nomenclature of Bacteria（ICNB；http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?indexed=google&rid=icnb.TOC）で規定されています。
ここで，Minimal Standards を制定する規則があり，これに基づいて各分類群ごとに Minimal Standards が与えられているため，
記載したい分類群ごとに Minimal Standards は異なります（未制定の場合もあるでしょう）。

ご質問者様の分類群に minimal standards が制定されているかどうかは，調べてみない限りわからないでしょう。
Minimal Standards のリストは下記にあります。
http://www.bacterio.cict.fr/minimalstandards.html

お礼

補足ありがとうございます。
詳しい説明ありがとうございました。正しく理解できたかなと思いますので、これから参照URLを読み込んで見たいと思います。