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ヒトゲノムのセンセーショナルなタイトル
- ヒトゲノムの遺伝子数とDNA識別標の関係について解説します
- DNA配列の長さとヒトゲノムの特異性について詳しく説明します
- ヒトゲノムのDNA配列における識別標の最小長さについて考えます
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もう宿題に間に合わないかもしれませんが、、 > なんで16乗が最小の16ヌクレオチドと結びつくのですか？ 1ヌクレオチドだったら4種類のパターンですから 4の1乗（G,A,T,C） 2ヌクレオチドだったら1塩基目が4種類、2塩基目も4種類で、それらを組み合わせると 4の1乗x4の1乗、つまり4の2乗種類のパターン（GG, GA, GT, GC, AG, AA, AT, AC, TG, TA, TT, TC, CG, CA, CT, CC） 3ヌクレオチドだったら1塩基目が4種類、2塩基目も4種類、3塩基目も4種類で、それらを組み合わせると4の1乗x4の1乗x4の1乗、つまり4の3乗種類のパターン（例は省略） 同様な論理で、16ヌクレオチドだったら4の16乗種類のパターンが存在します。このような計算の詳細は確率統計（？）の教科書をご参照ください。
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#1です。「連続する8ヌクレオチドは」は「連続する特定の長さのヌクレオチドは」と読み替えてください。間違えました。
お礼
4の何乗が3.2 × 10^9を超えるか考える必要があります（GATC４種類で配列を作るため）。これは4の16乗になります。つまり最小で16ヌクレオチド必要ということです。 やっぱりこのぶぶんがわかりません。 なんで16乗が最小の16ヌクレオチドと結びつくのですか？
塩基組成以外にも様々な仮定が必要ですが、そういったことを無視して計算してみます。 > have to be present once in the haploid human genome ということは半数体ゲノム中にユニークな配列でなければなりません。3.2 × 10^9ヌクレオチド中に存在する連続する8ヌクレオチドは、互いの重複も全て含めると全部で約3.2 × 10^9個です。その中でユニーク（present once）であるためには、4の何乗が3.2 × 10^9を超えるか考える必要があります（GATC４種類で配列を作るため）。これは4の16乗になります。つまり最小で16ヌクレオチド必要ということです。 これで半数体ゲノム中の任意の特定部位が識別できるということになりますから、必然的に25000個であろうと何個であろうと任意の特定遺伝子が識別できます。 25000個と敢えて強調しているのは罠でしょうか、それとも私の大きな勘違いでしょうか・・。間違っていたらすみません。
お礼
回答ありがとうございます。 わかりやすい回答でした。 あと英文DNA→CANなど間違っていました。すいませんでした。 これでおこられずにすみます。
お礼
なるほど。確率ですね。 最小で16ヌクレオチドあれば同じ組み合わせができないとゆことですか！すごいわかりやすいです。 宿題は急に休講になったので間に合いました。ほんとうにありがとうございました。