ベストアンサー RNAiについて 2008/12/11 02:52 siRNA, shRNA, miRNAの違いって何ですか？発現抑制の効果などにちがいがあるのですか？分子生物学にあまり詳しくないのでご教授いただけないでしょうか？ みんなの回答 （1） 専門家の回答 質問者が選んだベストアンサー ベストアンサー owata-www ベストアンサー率33% (645/1954) 2008/12/11 14:03 回答No.1 分子生物学に詳しくないということなので、細かい説明は省きます。 簡単に言うと siRNA（short interfering RNA）：長鎖のRNAやヘアピン構造のRNAからDicerにより切り出され作られた20数塩基からなる二本鎖RNAで、一本鎖に解離した後タンパク質とRISCと呼ばれる構造を形成する。これにより、片方の鎖と相補的な配列をもつmRNAを切断する。 shRNA（short hairpin turn RNA）：ヘアピン構造の小さなRNAで、細胞内でsiRNAとなる。 miRNA（microRNA）：20数塩基からなる一本鎖RNA（いわゆるnon-coding RNA）。生成過程はめんどくさいので省略する（知りたければ↓）。相補的な配列をもつmRNAに結合したり、siRNAのように切断をして発言抑制を行う。 と、言われている。ただ、実際はほとんどわかっていないのが現状（そしてちょっとうさんくさい） 参考URL： http://ja.wikipedia.org/wiki/MiRNA 広告を見て全文表示する ログインすると、全ての回答が全文表示されます。 通報する ありがとう 0 カテゴリ 学問・教育自然科学生物学 関連するQ&A RNAiについて shRNAの発現ベクターで、お奨めのものがありましたら、教えてください。 INVITROGENのmiR RNAi発現ベクターにも興味があります。説明を読むと、プロモーターの自由度が高く、CMVなどのプロモーターが使えるとのことなので、発現が強そうな気がします。miR RNAiのデザインが、どのくらい信用できるのかも含めて、経験をお持ちの方がいましたら、教えてください。 http://www.invitrogen.co.jp/rnai/mir_rnai.shtml RNAiについて教えて下さい。 生物学、分子生物学に詳しい方、教えて下さい。 RNAiは、センチュウ, コクヌストモドキ, ナミテントウ, ワモンゴキブリ, コオロギ, シロアリ, 酵母, イネ, シロイヌナズナ, タバコというような生物で確認されていると、wikipediaに記載されてあったのですが、ヒトでは、確認されてなかったり、起こらないのでしょうか? ヒトでは、レトロトランスポゾンの発現を抑えつける機構として、RNAiが働くと聞いたことが有るのですが、これはRNAiの機構によるものなのでしょうか? ヒトにおけるRNAiの機構に詳しい方是非とも、教えて下さい。よろしくお願い致します。 RNAi 実験における細胞トラブル 24welに接着細胞をps-(ペニシリン・ストレプトマイシン－)のMediumで播種し 24hr後にOligofectaminesi,siRNA,Opti-MEM,でComplexを100nM,50nM,20nM(siRNA濃度」で作成し Complexを添加する前に、Opti-MEMで１度洗浄してから（血清あり→血清なしへ)添加して 24hr,48hrで細胞生存率をみているのですが・・ 添加する前に顕微鏡で見る限りは細胞がいるのに 添加した後に顕微鏡で見ると細胞が少なくなるのです 手技やアスピレーターで吸うときの勢い・添加時の水流で細胞が流されているのかと考え 現在は１wellごとチップで吸っていっているのですが、それでも少しの改善程度です また、今月の頭から24well plateで生存率の実験をし始めたころから 細胞の調子がなんだかおかしく・・ コンタミのように、接着している細胞もいるのですが浮いたりして白く濁ったり あきらかコンタミみたいに黒い塊みたいなものが浮いていたりするのです なんだか気持が悪く、細胞をここ最近捨てては新しいのを起こしたりしている状態です。 これは、ペニストなしのMediumで少し長い時間かけて継代してしまうのが原因なのでしょうか？ また、OligofectamineやsiRNAによる毒性が原因なのでしょうか？ 6well palteで定量的遺伝子発現量の抑制確認実験をしていたときは 細胞が劇的にいなくなったり、細胞の調子がおかしくなるということもなかったのですが 6well plateからplateを96wellや24wellに変えてスケールダウンしたころからおかしいのです。 もし、何かお気づきの点や考えられる点がありましたら 助言いただけるとうれしいです、お願いいたします。 天文学のお話。日本ではどのように考えられていた？ OKWAVE コラム 遺伝子発現制御機構について 遺伝子発現制御機構である『siRNA』はどのような働きによって遺伝子の発現を制御するのですか？『siRNA』について、ささいなことでもいいので知っていることがあったら教えて下さい。また、参考になるものがありましたら、そこのアドレスを教えて下さい。 お願いします。 遺伝子をノックダウンして機能解析する方法 機能未知蛋白の機能を調べるために細胞株に過剰発現を試みたのですが大した成果が得られなかったので、今度はRNAiでノックダウンを行ってみました。 その際念のために複数種類のsiRNA(既製品3本)を使ったところ、全てフェノタイプが異なっていて、何がなにやら判らなくなってしまいました。 いわゆるオフターゲット効果という事ではないかと思っています。 しかし、siRNAの濃度を今以上に下げると、肝心のターゲットが抑制されなくなってしまうようで、さてどうしようか困っています。 こういう場合、実験の進め方としては、経験者の皆様ならどのような対処をなさいますか？ RNAiの条件検討に戻るべきか、全く別のアプローチを取るべきか。。 あまり時間もお金も無いので、どうしたものかと思案中です。。。 連続塩基数 ＲＮＡiというが手法を用いる場合、トリガーと遺伝子間で連続して一致した塩基数などが遺伝子間で調べられていますが、これはなぜですか。 自分で考えた限りではＲＮＡiはsiＲＮＡとよばれる２１～２３塩基の二本鎖ＲＮＡにより配列特異的に遺伝子発現が抑制される現象のようです。siＲＮＡの中央部１１塩基程度がｍＲＮＡに一致するとＲＩＳＣ複合体がｍＲＮＡを切断するようなのです。このことから、他の遺伝子と相同性や連続塩基数を調べて特異的に抑制できるか検討するのかなぁと思っているんですが・・・。 ご専門のかたやわかる方どうか正しいアドバイスをください。よくわかりません。 SiRNA SiRNA（低分子干渉RNA）とはどういったものでしょうか？また、このSiRNAについての研究はどのようなことがされているのでしょうか？参考になるサイトがありましたら、URL等を教えて下さい。よろしくお願いします。 生化学に詳しい方、教えてください 生化学の問題なのですが・・・ 問題文としては「魚介類遺伝子の発現調節メカニズムについて説明しなさい」とあります。 私は全く知識がなくて、調べてみたのですが、発現調節メカニズムについては原核生物と真核生物についてしか分かりませんでした。。 魚介類は真核生物なので真核生物の発現調節メカニズムについて記せば良いのでしょうか？調べたところによると、転写調節（つまり発現調節のことでしょうか？）には４種類あり、 (1)アクチベーター＋リガンドで転写を促進するケース (2)アクチベーターが転写を促進し、アクチベーター＋リガンドで阻害するケース (3)リプレッサーが転写を抑制し、リプレッサー＋誘導因子で転写が誘導されるケース (4)リプレッサー＋コリプレッサーで転写を抑制するケース ここまでは分かったのですが、この問いの場合はどれを記述したら良いのでしょうか？どうかお力をお貸しください（＞＿＜） 免疫染色について 免疫染色を行い、図のような結果が出たとします。 左はコントロールで、右は調べたいことで、この実験はレンチウイルスにEphB2とGFPとshRNAを導入して、EphB2の発現を抑制されるのかという実験です。 ここでこの結果の見方が分からないのですが、GFPで蛍光を見ているのに真ん中の図には赤色の蛍光があります。 これはどういう意味なのでしょうか？ 原理自体よく分かっていないのでこのような質問となってしまいましたが、分かる方よろしくお願いします。 シグナル分子 現在、ヒト細胞の遺伝子の数は３～４万個であるだろうということ、また、ひとつの細胞で恐らく1万個ほど発現しているだろうということまで生物学は進んでいます。この遺伝子のうち、シグナル分子はどれぐらい含まれているのでしょう。ってゆーかそもそもシグナル分子の定義って何？ 小生、シグナル分子の研究生ですが、ふと疑問にはまり抜け出れなくなりました。誰か助けて～。 （ひょっとして答えない可能性もあるんで…） 分子生物学を知らない人が発現系細胞作成のための本 分子生物学をまったく知らない人が蛋白の発現系細胞作成をやろうとしたときにスキーム等が書いてある分かりやすい本でお勧めなのってありますか？ バイオイラストレイテッドとかは見たことあるんですが． 遺伝子の過剰発現について 分子生物学初心者なので、簡単なことだとは思いますがよろしくお願いします。 遺伝子の機能を解析するために、その遺伝子を過剰発現させてフェノタイプの変化を見るという実験をしています。しかし、そもそも何で遺伝子を過剰発現させることにより機能が解析できるのか上手く説明できません。この分野の勉強を全くしていない人たちにわかりやくす説明するには、どうしたらいいでしょうか？よろしくお願いします。 日本史の転換点？：赤穂浪士、池田屋事件、禁門の変に見る武士の忠義と正義 OKWAVE コラム 脂質二重膜の水の透過について ヴォート基礎生化学第２版とLODISHの分子細胞生物学第五版には 水分子が生体膜を透過する時は生体膜にあるアクアポリンを通る事で生体膜を高速で透過でき、純粋なリン脂質二重層は全く水を通さないと書いてあります。(ex.カエルの卵母細胞にはアクアポリンが発現しておらずアクアポリンを発現させる事で水透過性が増す) 一方、細胞の分子生物学４版には タンパク質を含まない人工脂質二重層の透過性について、水や尿素のような小型で電荷のない極性分子は速度はかなり遅いが脂質二重層を越えて拡散する。人工二重層で調べると、水はNa+やK+のような小さなイオンの10^9倍もの透過性を持つと書いてあります ヴォート基礎生化学第２版とLODISHの分子細胞生物学第五版の方が新しくこちらの方が正しいと思うのですが、分子細胞生物学では水は純粋なリン脂質二重膜を全く透過しないと言っているのに対し、細胞の分子生物学ではわずかながら透過すると書いてあるため混乱してしまって どちらが正しいのでしょうか？ 遺伝子カタログ ある植物の花弁で発現しているすべての遺伝子のカタログを作りたいのですが、どういった実験手順をとればよいのでしょうか。分子生物学の基礎知識もとても十分とはいえない状態ですので、参考になる文献等も教えていただけるとありがたく思います。よろしくお願いいたします。 mockとcontroll 細胞へのトランスフェクションにおいて、 siRNAとネガコンを導入してタンパクの発現を比較したのですが、 僕がネガコンを導入した細胞をmockとよんでいたら先生に「mockとcontrollは意味が違う、この場合はmockではなくcontrollだよ」 と教えていただきました。 研究初心者でありmockの概念をいまいち理解していないのでmockとcontrollの違いが明確にわかりません。 本などで調べてもそこまで基本的なことは載っていないので困っております。mockとcontrollの違いを教えていただけないでしょうか？ 劣性遺伝子の転写調節 劣性遺伝子はどのように発現が抑制されているんですか？ 転写調節（もしくは翻訳調節かもしれません）のメカニズムをご存知の方がいたらご教授願います。 生物学の質問 遺伝子発現における原核生物と真核生物の様式の違い、およびそれぞれの様式の利点と欠点について教えていただけると幸いです。 ＡＴＰ合成酵素？？？ Ｆ0Ｆ1ＡＴＰ合成酵素はどんな機能をもっているんですか？ あと、遺伝子の発現における真核生物と原核生物の違いについてもわかれば教えてください お願いします カタボライト抑制 発現ベクターに目的遺伝子（グルカナーゼ）を導入して発現実験をしています。培地にグルコースを入れるとカタボライト抑制がかかると先輩に言われたのですが、発現ベクター内には目的遺伝子のみ（制御系タンパクなど入れていない）しか入っていません。なぜカタボライト抑制がかかるのでしょうか。どなたか教えてください。 真核生物由来の遺伝子を原核生物で発現させたいとき 真核生物由来の遺伝子を大腸菌のプラスミドＤＮＡに組み込み、 そのプラスミドを大腸菌に形質転換し、 得られたタンパク質を精製してSDS-PAGEでサイズの確認を行いました。 その結果、目的のタンパク質の分子量を示す位置にバンドが得られたため、 実際に活性測定を行ったのですが、 酵素活性は検出されませんでした。 この結果について、以下のように考察しました。 真核生物の発現調節はとても複雑なため、 原核生物である大腸菌で発現させた場合、 実際に得られたタンパク質と目的のタンパク質の分子量と一致したとしても、 正しいフォールディングが取れていないことがある。 このため、酵素としての活性が検出されなかった。 合っているでしょうか・・・？ 他にも何か原因があるようでしたら教えてください。 注目のQ&A 「You」や「I」が入った曲といえば？ Part2 結婚について考えていない大学生の彼氏について 関東の方に聞きたいです 大阪万博について 駅の清涼飲料水自販機 不倫の慰謝料の請求について 新型コロナウイルスがもたらした功績について教えて 旧姓を使う理由。 回復メディアの保存方法 好きな人を諦める方法 小諸市（長野県）在住でスキーやスノボをする方の用具 カテゴリ 学問・教育 自然科学 理科（小学校・中学校）化学物理学科学生物学地学天文学・宇宙科学環境学・生態学その他（自然科学） カテゴリ一覧を見る OKWAVE コラム 突然のトラブル？プリンター・メール・LINE編 携帯料金を賢く見直す！格安SIMと端末選びのポイントは？ 友達って必要？友情って何だろう 大震災時の現実とは？私たちができる備え 「結婚相談所は恥ずかしい」は時代遅れ！負け組の誤解と出会いの掴み方 あなたにピッタリな商品が見つかる！ OKWAVE セレクト コスメ化粧品 化粧水・クレンジングなど 健康食品・サプリ コンブチャなど バス用品 入浴剤・アミノ酸シャンプーなど スマホアプリ マッチングアプリなど ヘアケア 白髪染めヘアカラーなど インターネット回線 プロバイダ、光回線など
