細菌からのRNA抽出について

質問

非常に少ない細菌数の培養サンプルからRNAを抽出しようと考えています。遠心分離では細胞ロスが大きいと思われるため、培養液をろ過して、ろ紙に残った細菌からRNAを抽出しようと考えていますが、このようなことは可能でしょうか。可能であれば、何かよい抽出キットなどあれば紹介してください。

回答No.2

noname#246619

回答ではないですが、この質問に興味があります。
経験者の方がおられるとよいのですが...

参考URLにフィルターの選び方が載っているのを見つけました。
あるいは滅菌のためのフィルターはそういう用途にも使えるのかもしれません。
海水などからDNAやRNAをとってメタゲノム解析をやっている例なども参考になるかもしれませんね。

参考URL：

http://www.advantec.co.jp/japanese/hinran/tanpin/mf.html

お礼

確かに、海水など細菌バイオマスの少ないサンプルからの核酸抽出法は参考になるかもしれませんね。ありがとうございました。

回答No.1

MIYD

菌を増やせない理由があるのですか？

ろ紙から細菌を回収するほうが、遠心よりも回収率が落ちると思いますが…

補足

菌は増やせないわけではなくて、培養仕立てでは細菌量が凄く少ないわけです。RNAの経時変化を追って行きたいので、こうした初期の少量の細菌からRNAを取りたいのです。