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RNAのバンドについて
こんばんは。 実験で大腸菌DNAを抽出し、アガロースゲル電気泳動して撮影したところ、バンドが4本でました。 1番上がDNAによるもので、あと3つはRNAによるものだそうですが、その3つが、順にどのRNA(mRNA、rRNAなど)なのか、実験書などを調べたのですが特定できません。 ご存知の方、アドバイスをいただけないでしょうか。
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- MIYD
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回答No.2
大腸にはプラスミドが入っているのでしょうか また精製方法は何でしょうか プラスミドが入っていないのならば、4本は ゲノムDNA 23SrRNA 16SrRNA 5SrRNA(+分解物など?) かもしれません RNAの大部分はrRNAです
- antibiotic
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回答No.1
4本バンドが出たとのことですが、おそらく上3つがDNAのバンドで、一番下がRNAのバンドでしょう。 解説ししますと、1番上がDNAの2本鎖の片方にニックがはいったもの。2番目が、DNAが開環状のもの。3番目が、閉環状のものになると思います。そして4番目が、RNAのバンドだと思われます。 間違いございましたら、ご指摘願います。
質問者
補足
ありがとうございます。 ただ、RNaseを用いると下の3本のバンドが消失したので、おそらく教授の言うとおり下の3本がRNAではないかと思うのですがどうでしょうか。
補足
染色体DNAの分離と解析を目的とした実験です。プラスミドは入っていません。 リゾチーム処理、SDSによる溶菌、フェノールによるタンパク除去、エタノール沈殿でDNAを分離し、アガロースゲル電気泳動を行いました。 サンプルは4種で、DNAに 1.何も加えない 2.DNase 3.RNase 4.EcoRI+BamHI を加えたところ、1で4本のバンド、3で1本のバンドが出たため、3本がRNAであるというところまで判明しています。