AGPC法について/RNAの電気泳動について

質問

・AGPC法がRNAとDNAの性質の違いで、RNA抽出を行うことはわかりまし　た。が、RNAとタンパク質の性質を比較したときにうまく説明ができ　ません。解説お願いします。
・RNAの電気泳動を行ったときにRNAがどのようなバンドやスメアでみえ　るかの解説お願いします。

回答No.1

MIYD · ベストアンサー

フェノール/クロロホルムによってタンパク質中が変性し、
タンパク質の性質(配列)によって有機層、中間層、水層にきます。
RNAには疎水性部分がない(または非常に少ない？)性質と比較して説明してはいかがでしょうか。

AGPC法でとった場合、mRNA,tRNA,rRNAが取れます。
通常の泳動では5SとtRNAはバンドにならず、
比較的量の多いリボゾーマルRNAのバンドが2本、
(バクテリア,真核生物などでサイズは変わります)
mRNAがスメア状に見えます。

お礼

わかりやすい説明、とっても参考になりました。ありがとうございました。またよろしくお願いします。

回答No.2

noname#246619

AGPC法を利用した試薬のマニュアルをご覧になることをお勧めします。
泳動は、何を見たいかによりいくつかの泳動法があり、バンドの見え方はその方法によります。

参考URL：

http://www.nippongene.com/pdf/man_isogen.pdf,http://www.nacalai.co.jp/toriatukai/pdf/24-31.pdf