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遺伝子の染色体上の有無を調べる方法
バイオインフォマティクスではない実験でヒトのある遺伝子が性染色体上(X、Y)にあるかどうかを実験的に調べる方法を教えてください。 in situ hybridizationを用いた方法は知っているので それ以外にあったら教えてください。
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- teru-arai
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性染色体ということはないのですが、どの染色体に存在しているかはだいぶ昔から遺伝学の手法を用いて調べられてます。生物学の常識ですから詳しい説明は不要でしょうが、遺伝的交差の頻度を調べることでショウジョウバエなどでは詳細な遺伝子マップが作られています。各遺伝子は連鎖群(連関群)とよばれる群にグループ分けされてますが、この群が染色体に相当します。ヒトの場合実験ができないのであまり詳しい解析はできまてせんが、連鎖群も分かってましたし、マップもありました(シークエンスが終わった今となっては、過去形でいいでしょう)。 細胞工学を用いた手法には二つあります。一つはヒトとたとえばマウスとの融合細胞を作る手法です。できた融合細胞にはマウスとヒトのゲノムがそれぞれ1セット入っています。この融合細胞を培養していくと、そのうちにヒトの染色体がランダムに少しずつ欠落していきます(どういう訳か欠落するのはヒトの染色体です)。従って、そのうちヒトの1番染色体と5番がない細胞、2番がないもの・・・と色々そろいます。各細胞を使ってサザンでもやれば、どの染色体に載っているか調べることができるでしょう。 もう一つは、マウスなどの細胞にヒトの染色体を放り込む手法で、ヒトの染色体が一本だけ入ったマウス細胞を作ることが可能です。これは鳥取大学医学部のグループが世界をリードしています。ヒトの抗体を産生する染色体をマウスの細胞にいれ、ヒトの抗体を産生するマウスを作成するなどということができます。別に、どの染色体にどの遺伝子が載っているかを調べているわけではないですが、ワンセットそろえればそれも可能でしょう。
- teru-arai
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性染色体に特異的なやり方というのは知りません。 普通の遺伝学的なやり方、細胞工学的なやり方じゃ、どの染色体に乗っているかは関係なく、どれにのってるかわかるからね(もっとも、Yは難しいのだろうけど)。
補足
その遺伝学的なやり方、細胞工学的なやり方を 教えてください。