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コロニーPCRって?
大学1年生です。 コロニーPCRとは、普通のPCRとどのように違うのでしょうか? シークエンス前に「目的のDNAがちゃんと入った大腸菌コロニーの目星をつけておく」という目的で行ったりする、と習ったのですが…
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プラスミドベクターに目的のDNA断片をクローニングしたいとき、酵素でつなげて大腸菌に入れてやりますね。ベクターには薬剤耐性遺伝子が乗っているので、選択薬剤を入れた培地上にはベクターが入ったものだけが生えて、これがコロニーを形成するわけです。一つのコロニーは一匹の大腸菌がふえたもので、同じベクターを持ったクローンです。 すべてのコロニーが目的のDNAをもったクローンである訳ではなく、外来DNAが組み込まれていないベクターだけだったり、目的外のDNAが入ったベクターだったりすることも多いのです。そのため、目的のDNAをもったクローンを見つけ出す必要があります。 古典的には、各コロニーから大腸菌を培養してプラスミドを精製し、これを分析することで目的のクローンを選び出します。 そのかわりに、コロニーからとった少量の大腸菌からPCRを行って目的のDNAを持っているクローンを選び出すのがコロニーPCRです。 >コロニーPCRとは、普通のPCRとどのように違うのでしょうか? PCRはPCRですが、コロニーを出発材料にしてPCRをするというだけです。
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- tunertune
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回答No.1
コロニーを直接サンプルとしてPCRを行うことです。 PCRをちゃんと理解していますか? そうでなければ、ここで質問しても満足する答えが見つかるかどうかあやしいですよ。
質問者
お礼
ありがとうございます。 そうですね、もう一度PCRについて勉強してみます。
お礼
ありがとうございます。 とてもわかりやすくて助かりました。