PCRの伸長反応について

質問

PCRの伸長反応は，用いるDNAポリメラーゼによって僅かに異なりますが，大体70度前後だと理解しています．
ところが，sequence reactionのサイクルでは伸長反応は60度と習いました．
これは普通のPCRで用いるポリメラーゼとsequence reactionで用いるポリメラーゼが全然違うものだからなんでしょうか？

回答No.1

geneticist12 · ベストアンサー

アプライドバイオシステムのシークエンス反応のことだと思いますが、酵素はTaqです。
どうして60度で反応させるのか、、、、、
それは、いろいろためして最適化した条件がそうだからです。
PCRは、伸びればいい、増えればいいですから、酵素の至適温度でやるのがいいわけです。
シークエンス反応は、そういうことを目指しているのではなく、たとえば、ラベル化されたヌクレオチドをバランスよく取り込むとか、鎖長がちがうDNA分子が、偏りなく生成されるとかのほうが大事です。当然、至適化のポイントも違う訳で。

ちなみに、耐熱性ポリメラーゼといっても、室温付近からかなりの活性があります。低温条件でおこる非特異的な反応を防ぐために、ホットスタート法などがあるのもそのためです。