ＰＣＲのプライマーについて

質問

こんにちは。少し前から微生物について学び始めた学生です。
このたび基礎実験で、ＰＣＲを行うことになりました。そこで大腸菌だけを特異的に検出するためのプライマーを探しています。
自分で文献などを調査してみましたが、いいものが見つかりません。
どなたか大腸菌だけを特異的に検出できるプライマーについての情報をお持ちの方がいらっしゃいましたら、教えてくださいませんか？よろしくお願い致します！
参考になるサイトや文献など、もしご存知でしたら重ねて教えていただけると幸いです。

回答No.1

mizu_atsu · ベストアンサー

PCRで大腸菌ですか？
一組のプライマーだけでは厳しいように思います。
大腸菌だけが特有にもっている遺伝子があればいいのですが思いつきません。
食品業界で大腸菌群（※大腸菌を含む郡であり大腸菌だけではありません）はデスオキシコーレイト培地という選択培地です。
大腸菌郡はデスオキシコール酸ナトリウムを分解することによりこの培地で生育することができます。
これに関わる遺伝子のプライマーと大腸菌が持っている（多分他の菌でももっているものがある）βガラクトシダーゼの遺伝子のプライマーの両方陽性ならかなりの確率で大腸菌だと言えるように思います。他の遺伝子も組み合わせれば確実性があがることでしょう。
もっとも試料中にグラム陰性菌があまりいなかったら少ないプライマーでもいけるかもしれません。

お礼

早速お返事頂きましてありがとうございます。
大変参考になりました。
もう少し方法について検討してみたいと思います！