サザンハイブリダイゼーション

質問

今大学で、ハイブリダイゼーションを勉強している者です。ある本で、サザンハイブリダイゼーションを使って、遺伝子の数を決定できると書かれていたのですが、具体的にはどうやるのでしょうか？いまいちイメージがわかないので、わかる方がいらっしゃいましたら教えて下さい。

回答No.1

MIYD

遺伝子の数とは何を意味しているのでしょうか。

パラログを意味しているのでしたら、
適当な制限酵素で切ってサザンをやると

---a-----
--a---
--a-
-a-
a-
のようなバンドが検出されて、
パラログの数がわかります。
実際には複数の制限酵素で調べることになります。

遺伝子の数がコピー数を意味している場合は
(パラログの配列が似ていて制限酵素で分離できない場合も含む)
同じメンブレンにいろいろなコピー数のプローブを載せておくことにより、
バンドの濃さで何コピーかを調べます。

サンプル　1コピー　10コピー　100コピー
　-a-*N　-a-*1　　-a-*10　　　-a-*100　

サンプルがヒトゲノム10ug、プローブ(とサンプル)のサイズが3*10^3とすると、
1コピー　3*10^9:3*10^3=10ug:x ug　で10pg
10コピー　 100pg
100コピー 1000pg
のプローブを流す。

内在性の遺伝子だと通常2コピー単位で存在することになるかと思います。

補足

説明が足りなくてすいません。遺伝子の数というのは、たしかヒト一倍体ゲノムあたりに、ある遺伝子がいくつあるかです。
MIYDさんの、回答では後者の方だと思います。