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残基についての疑問
- 質問文章では、細菌のDNA分子量やヌクレオチドの平均分子量についての問題がありますが、残基についての理解に疑問が生じました。
- 特に、問題においてアミノ酸の平均分子量を求める際に、残基と明記されていないのにも関わらず、-18を行わずに計算する理由があります。
- 質問者は、なぜ-18をするのか疑問に思っています。
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- guragura77
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核酸にしろタンパク質にしろポリマーの分子量とモノマーの分子量でヌクレオチド数やアミノ酸数を算出するなら、ヌクレオチド残基やアミノ酸残基の分子量を使わなければなりません。 「1対のヌクレオチドの平均分子量」からは 36 を、「アミノ酸の平均分子量」からは 18 を引いて残基の分子量にします。 ポリマーの末端の残基は片側しか脱水縮合していないので、ポリマーの分子量から 18 を引いて全ての残基の両側が脱水縮合したものとして計算しなければなりません。もちろん二本鎖 DNA の分子量からは 36 を引きます。 質問のヌクレオチドの問題は (2.6 x 10^9 - 36) / (6.6 x 10^2 - 36) 有効数字が二桁なので、途中計算は三桁で行ないます。 分母のヌクレオチド残基の分子量を計算すると 6.24 x 10^2 ですから、有効数字で無視できる誤差の範囲を超えてます。 分子は三桁に直すと 2.60 x 10^9 なので、-36 は有効数字で無視できるということになります。 タンパク質の方も同様にアミノ酸残基の分子量にとって水の分子量は無視できませんが、タンパク質の分子量に対して水の分子量は無視できます。
お礼
なるほど！！！理解できてきました。 わかりやすい説明のおかげです。 ありがとうございました。
- overthisgraysky
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１番目の回答者です。 私も問題を考え間違いしており、アミノ酸の分子量から１８を引くということを全然考えていませんでした。 その場合は残基かどうかは大切な判断ポイントですね。 ２番３番の回答者さんの書いてらっしゃることが正しいと思いますので、私の回答は参考にしないようにしてください。 混乱させてしまってごめんなさい。
お礼
わざわざありがとうございます。 ＞混乱させてしまってごめんなさい。 とんでもないです。 むしろ、回答していただいて本当に感謝しています。 ありがとうございました。
- thegenus
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アミノ酸が結合するごとに水分子（分子量18）が取れるのですよね。 三つのアミノ酸なら、二つ水分子が取れるのです。100個のアミノ酸がつながれば、99個の水分子が取れるのです。 アミノ酸がN個つながれば、（N-1）個の水分子が取れるのです。 以上が難しいのならば、 単純にアミノ酸一つの平均分子量（138）から水分子の一つ分を引いた、いうなればアミノ酸残基の平均分子量（138-18）だけで考えてもいいですよ。 タンパク質は、アミノ酸残基が連結していると考えれば、アミノ酸残基の分子量で、タンパク質の分子量を割ればアミノ酸の数がでるでしょう。アミノ酸の数をNとすると。 N＝ ４.８×１０＾４÷（１３８-18）＝48000 ÷ 120 ＝400 何から18を引くべきなのかを考えるか、教わるかしてください。引く相手を間違えていませんか。
お礼
再度ありがとうございます。 はじめは混乱していたのですが、おかげでだいぶ 理解できました。ありがとうございました。
- overthisgraysky
- ベストアンサー率29% (78/267)
-18はもしかして、端にあるHとOHの分子量でしょうか？ 平均分子量を使った概算なので１８くらいは無視できると考えていいと思います。 残基と書かれているかどうかで判断するのは何か変です。 学校でそう習ったんでしょうか？ あと、一般的に残基と言ったら蛋白質を構成するアミノ酸ひとつひとつのことを指していて、核酸の場合は残基とは言わず塩基（対）と言います。
お礼
解答ありがとうございます。 ＞残基と書かれているかどうかで判断するのは何か変です。 ＞学校でそう習ったんでしょうか？ そうです。もし、残基とかかれていなかったら、－１８をして計算することと 教えられたので、この問題もそうなのかなあ？と思ってしまったのですが。。。
お礼
解答ありがとうございます。 まだちょっと混乱しているのですが、詳しいわかりやすい 説明のおかげで理解できた気がします。 ありがとうございました。