限外ろ過について

質問

私はタンパク質を扱う実験をしています。
タンパク質を大まかに分画しようと、限外ろ過を行いました（分子量1万のフィルターを使いました）。
限外ろ過したタンパクをSDS-PAGEで確認したところ、フィルターを通過したタンパクなのに分子量４万くらいのところにもはっきりバンドが出てしまいました。フィルターを別の会社のものにしても同じ結果になります。

粗タンパクと一致するバンドなので、コンタミではないと思うのですが、どのような原因が考えられるのでしょうか。
ご意見よろしくお願いいたします。

回答No.1

kgu-2 · ベストアンサー

限外濾過は、この２０年やっいませんが。

　膜に空いている穴は、1万より大きいものを通過しにくいだげて、絶対にとおらない、という代物ではありません。そもそも、１万は通すが、10001なら通さない、なんてことはありません。４万なら、やや通りにくい、という程度です。
　膜を通すと、４万の割合が減っていると想いますが。分子量が大きくなるにつれて、その割合が減っているハズです。
　また、タンパクの形状の問題も。同じ分子量であっても、球形のタンパクとラクビーのボールのようタンパクだと、濾過される率は異なります。

お礼

膜を通すと確かに大きいタンパクの出る割合は減っていました。タンパク質の形状については頭に入れていなかったので、勉強になりました。
ご回答いただき、どうもありがとうございます。