遺伝子の塩基配列の調べ方

質問

ヒトのALDH2遺伝子の全塩基配列（エクソン部及びイントロン部の配置）を調べたいのですが、どうやって調べていいのかがわかりません。
検索サイトで検索かけてみたりしたのですが見つかりません。（ネット上にデータベースがあるというのを聞いたことがあります。）
調べる方法を教えてください。お願いします。

回答No.2

Chicago243 · ベストアンサー

NCBIの場合
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
seachの選択項目の中からgeneを選びALDH2を検索します

ALDH2がテキストに含まれるデーターのリストが得られると思いますので、適切な物を選択してください
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=Retrieve&dopt=full_report&list_uids=217
ここから、Related Sequencesのgenomicを見つけてそのシーケンスを見てもいいのですが非常に長いテキストで、目的のもの以外の配列も入っていることもかなりありますので、右のlinksから、Map viewerに飛びます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/maps.cgi?taxid=9606&chr=12&query=uid(14218883)&QSTR=217%5Bgene%5Fid%5D&maps=gene_set&cmd=focus

ALDH2 OMIM HGNC sv pr dl ev mm hm sts.... という文字列があると思います。dlをクリックしデーターを取得するページに飛んで Display かSave to Disk データーを得てください。

ほかのデーターベースだと
http://www.ensembl.org/index.html
のhuman
http://www.ensembl.org/Homo_sapiens/index.html
の右上からALDH2検索
詳細は省略します。ひつようであればおっしゃってください。

お礼

ありがとうございます！
とても丁寧でわかりやすいです！

回答No.1

gori8063

データベースはたくさんありますので、使い勝手、知っている／いないでいおりろなデータベースを紹介されるかと思いますが、遺伝研あたりから入っていくのが日本語ですし分かりやすいかと思います。
http://www.nig.ac.jp/section/service-j.html
http://www.ddbj.nig.ac.jp/Welcome-j.html