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塩基配列の検索について
ある塩基配列の中から、特定アミノ酸配列をキーワードとして検索するツールまたは方法があれば教えてください
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noname#67386
回答No.1
アミノ酸シークエンスが手元にあるならば proteinBLASTが最も一般的で確実でしょう。 NCBIのホームページよりBLASTのページに進み、 protein BLASTに進みます。 配列をフォームに入力し、BLASTをクリックします。 あとはNCBIのデータベースより相同性のあるタンパク質を検索してくれます。 各種パラメータを設定できますが、設定しなくても十分使えるはずです。
- 参考URL:
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
お礼
参考になりました。 ありがとうございました。