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遺伝子のモチーフサーチについて

遺伝子のコード領域のATGより上流領域を単離してきた場合、その上流領域にどんなモチーフがあるかどうかをみるために、適したデータベースサイトはあるのでしょうか。 いろんなデータベースでモチーフ検索があるようですが、だいたいがアミノ酸でのモチーフ検索で、ATGより上流領域のアミノ酸に変換しようがない領域(たとえば、TATAボックスを含む領域など)のモチーフの検索は、どうすればいいか、よくわかりません。

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  • meineko
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回答No.1

植物でよければ、 http://www.dna.affrc.go.jp/htdocs/PLACE/ というのがあります。 よく使ってます。 その他生物一般なら http://tfbind.ims.u-tokyo.ac.jp/ 有名らしいのですが、使ったことはありません。

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