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プロモータ領域の調べ方
たとえば「IL-2のプロモータ領域にはどんな転写因子の結合部位が存在するか」を調べるにはどのようにすればよいのでしょうか? 論文ベースの調べ方では断片的に発見できるものの網羅的なものは発見できませんでした。このようなことを述べているreviewは存在しうるのでしょうか? プロモータ配列を調べて目的の配列と照らし合わせるという方法になってしまうのでしょうか… ちなみに知りたいのはIL-2とIL-6です。
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- ga111
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回答No.1
これらなどいかがでしょう? http://bioportal.weizmann.ac.il/toolbox/seq_analysis/promoters.html#transcription # Transcription Binding Tools # ALIBABA - predicts transcription factor binding sites by constructing matrices on the fly from TRANSFAC # Cister - Cis-element Cluster Finder # COMPEL - database on composite regulatory elements affecting gene transcription in eukaryotes
お礼
ご返答ありがとうございました! 具体的な方法がまだ見出せずにいますが、これらのサイトの中に解答がありそうですので是非参考にさせていただきます!