TukeyHSDとTukey法について。

質問

TukeyHSDとTukey法って違うものですか？
統計ソフトRを使っています。Tukeyを用いて多重比較をしたいと思い、調べていると、
TukeyHSD()
→http://www.nanzan-u.ac.jp/~kamiya/r/ana3type.html
とTukey()
→http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/tukey.html
がでてきます。これらに違いはあるのでしょうか。どちらを用いれば良いか分からず困っています。
Rも統計も初心者です。お願い致します。

回答No.1

noname#227064

出力されている内容が少し違うだけで、どちらも同じものです。
TukeyHSDはgroup間の差とその信頼区間とp値、Tukeyは統計量とp値を出力しています。
p値をみると同じであることから、それがわかると思います。
データはどちらもhttp://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/tukey.htmlのテストデータを使用しました。

TukeyHSDの出力結果
diff lwr upr p adj
2-1 1.1964286 -0.6753086 3.06816577 3.630248e-01
3-1 2.9047619 0.8927049 4.91681894 1.975521e-03
4-1 4.7142857 2.7811638 6.64740758 6.970838e-07
5-1 2.7142857 0.7811638 4.64740758 2.687670e-03
3-2 1.7083333 -0.2448214 3.66148809 1.090560e-01
4-2 3.5178571 1.6461199 5.38959435 6.039780e-05
5-2 1.5178571 -0.3538801 3.38959435 1.567591e-01
4-3 1.8095238 -0.2025332 3.82158084 9.414444e-02
5-3 -0.1904762 -2.2025332 1.82158084 9.986795e-01
5-4 -2.0000000 -3.9331219 -0.06687813 3.978055e-02

Tukeyの出力結果
t p
1:2 1.854090 3.630248e-01
1:3 4.187543 1.975521e-03
1:4 7.073685 6.970838e-07
1:5 4.072727 2.687670e-03
2:3 2.537026 1.090560e-01
2:4 5.451580 6.039780e-05
2:5 2.352204 1.567591e-01
3:4 2.608633 9.414444e-02
3:5 0.274593 9.986795e-01
4:5 3.000957 3.978055e-02

お礼

そうなんですか・・・
ありがとうございます！助かります。