遺伝子検索方法についての質問

質問

マウス　P27 　KO標的遺伝子の遺伝子マップを知りたいのですが方法をお教え下さい。

回答No.2

MIYD

>免疫に関するDNA領域を探しております。KO標的遺伝子をPCRにかけるため
前者と後者は別の仕事だと思いますが、何をしたいのですか？

これからターゲティングするためのホモロジーアームをクローニングするのですか？
上流、下流それぞれ必要な長さをクローニングするためのプライマーセットを、
Tm値を考えながら30mer位で設計すればいいでしょう。

お礼

ご回答有難うございました。
実はKOの5’3’プライマーとWTの5’3’のプライマー
ともに設計された遺伝子配列は分かっております。目的遺伝子の
遺伝子マップを手に入れる機会を逃したため、その遺伝子領域を
プライマーから特定しようとしております。
（本来なら手順は逆ですが・・・）

回答No.1

MIYD

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/map_search.cgi?chr=mouse_chr.inf&query=p27

p27と呼ばれる遺伝子は複数ありますけど。
Cdkn1b のことですかね。

お礼

ご回答頂き有難うございました。
免疫に関するDNA領域を探しております。KO標的遺伝子をPCRにかけるためのP27 KO　プライマーはどう設計すれば良いのでしょうか？