連鎖不均衡について

質問

文献で、ある多型と多型が高度に連鎖不均衡の関係にあるという内容の文章がありました。高度に連鎖不均衡というと大体どの程度のことを言うのでしょうか。何か基準のようなものがあるのであれば教えて頂ければ幸いです。宜しくお願い致します。

回答No.1

popporu · ベストアンサー

「高度に」という表現を使うときには特に決まりはないとおもいます。
データを扱う各々が決めることです。
ご存知かもしれませんが、連鎖不均衡(連鎖不平衡？)の程度を表すのにD'値、r2など、計算により得られる値を用います。例えばD'値が１のとき、二つの多型が完全に連鎖していて低くなるほど連鎖が弱いことを表します。詳しいことはよく分かりませんが、見てる印象としてはD'値が0.8とか0.9以上の連鎖を、非常に強いと言うことが多いように思います。
正直あまり説明できませんので、D'値、r2などについてはネット等々でお調べください。一応参考URLも。

参考URL：

http://www.genstat.net/ldmeasure.html

お礼

詳しいご回答有難うございました。非常に分りやすかったです。URLもかなり参考になりました。これから色々勉強しようと思います。お礼が遅くなりまして申し訳ございませんでした。