制限酵素について

質問

特定の6塩基配列は平均すると、何塩基ごとに出現するか？
という問題が非常に分からないんでどなたか分かり次第回答お願いします。

回答No.1

Freeuser · ベストアンサー

ある特定の配列が出てくる確率ですね。むしろ数学カテか。

DNAの塩基はA,T,G,Cの４種類ですね。
たとえば、BamHIという制限酵素の認識配列、GGATCCという配列は平均して何塩基ごとに出現するかという問題だと、

ある連続した6塩基の配列を見たときに、その配列がGGATCCである確率はどれくらいでしょうか？
それぞれの塩基は同じ確率で出現すると考えれば、それぞれ1/4ですから・・・・・・。数学ですよ。

ほら、こたえがでちゃった。
任意の6塩基配列はすべて同じ答えになります。

実際には、生物によって若干塩基の組成や配列の偏りがあるので、理想どおりにはいきません。