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系統樹について
CLUSTAL Wを用いて系統樹の作成を行ったときに、枝分かれの部分に数値が書いてあるのですが、この数値は何を表しているのですか？ブーストラップ値と書いてあるものもあったのですが、それならば100を超えないはずですよね？書いてある数値は500～1000です。どうかよろしくお願いします。
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ブートストラップ値と言うのは、系統樹において分岐の信頼性を示すために用いられる指標であって、これは決められた回数のランダムな試行に対して同じ分岐が得られた回数を示すものです。 なぜ100を超えないと思っているのかわかりませんが、試行回数が1000になってるのではないですか？恐らくdefaultで1000になっているのでは。任意で回数は変えられるはずです。回数を100にすれば、当然数値が100を超えることはなくなります。
お礼
回答ありがとうございました。ブーストラップ値というものがパーセンテージで表示されるものかと思っておりました。回数の結果なんですね。