ベストアンサー 繰り返し配列 2001/06/16 14:23 最近、ヒトゲノムの話題を多く耳にしますが、その中で「繰り返し配列」なる気になる言葉がありました。 ゲノム配列の中には多数存在するということですが、どういったものなのでしょうか？教えて下さい。 みんなの回答 （2） 専門家の回答 質問者が選んだベストアンサー ベストアンサー m_nkgw ベストアンサー率47% (42/89) 2001/06/18 15:22 回答No.2 「繰り返し配列」と一言で言っても多くの種類があります。2塩基が何十対も繰り返されるもの（(TA)nなど）、3塩基のもの（(CAT)nなど）・・・10塩基以上の繰り返し配列も多くあります。また厳密には繰り返しでなくとも「繰り返し配列」とみなす部分も多くあります。 繰り返し回数はヒト個体それぞれによって異なるものや民族や種で異なるものなどさまざまです。また、繰り返し配列の存在する部分も染色体のあちこちに散らばっています。セントロメア（動原体に近い部分）やテロメア（染色体の端）には比較的多くの繰り返し配列があります。 現在のところこういった繰り返し配列には積極的な意味や機能（翻訳されてたんぱく質になる）はないと一般には考えられていますが、もしかしたらあっと驚くような重要な意味があるのかもしれません。（その一部がNHKの「人体III」で紹介されていましたよね） 広告を見て全文表示する ログインすると、全ての回答が全文表示されます。 通報する ありがとう 0 その他の回答 (1) inoue64 ベストアンサー率29% (334/1115) 2001/06/16 16:57 回答No.1 ここを参考にしてください。 参考URL： http://www.asahi-net.or.jp/~yb9n-okmt/lec2.html 広告を見て全文表示する ログインすると、全ての回答が全文表示されます。 通報する ありがとう 0 カテゴリ 学問・教育自然科学生物学 関連するQ&A 遺伝子のゲノムの計算 ヒトの１倍体ゲノムは約3.0×10＾9塩基対(bp)で構成され、25000遺伝子の存在が予想される。 遺伝子の平均長が3.0×10＾4bpの時、ヒトゲノムにおける非遺伝子配列の全ゲノムに対する存在率は何％になりますか？また、上記ヒトゲノムにおけるアデニン含有が1.8×10＾9個であった時、同ゲノムのグアニン・シトシン含有（GC％）は何％となりますか？ すみませんが計算の途中の過程や解説もできるだけ詳しくお願いします。 DNAでまだ分かっていないことって何ですか？ DNAに関する質問なのですが、 ゲノム解析を行うことで、ヒトゲノムを始めとして、他のゲノム配列も徐々に明らかになってきつつあります。 またAFMやSTMを用いて、DNAの塩基配列を認識することも出来るようになってきています。 それでもなおまだDNAの論文が結構出ているところを見るとまだDNAに関して分かっていないことがあるようなのですが、一体どういうところが分かっていないのでしょうか？ 専門家でない人に分かるように最近のDNA研究のトレンドについて教えて頂けないでしょうか？ 高校生物のゲノムの問題 お願いします。 問 1 ( 1 ) ヒトとチンパンジーのゲノムの塩基配列を比較すると約1.2%の違いがある。両種のゲノムの塩基配列は30億の塩基対 で構成されるとすると、両種のゲノム間の塩基配列において異なる塩基対の総数を求めよ。 ( 2 ) ヒトどうしのゲノムの塩基配列の比較では平均0.05%の塩基対に違いがあるとされる。このとき、同じ遺伝子(相同遺伝子)の塩基配列には、平均何個の塩基対の違いがあるか求めよ。ただし、ヒトゲノムには2万個の遺伝子が存在し、遺伝子がのっている領域はゲノムの3%とする。端数が出た場合は、四捨五入して小数点以下第二位まで求めよ。 天文学のお話。日本ではどのように考えられていた？ OKWAVE コラム プライマーの配列問題 今、考えている問題なんですが。 ヒトのゲノムはほぼ3*10^9bpである。10塩基からなるプライマーと相補的な配列が、この中にいくつ現れるか計算しなさい(2本鎖であることを考慮すること)。ただし、4種の塩基の存在確率は等しいものと仮定する。 全く解くための方針が見つかりません。どなたかアドバイス頂けないでしょうか。 ゲノム解読とコンピューターの性能は比例しますか？ 昨日、ヒトゲノムについて皆さん教えてくれてありがとうございました♪あれからずっとヒトゲノムの本を読んでいます。 本を読んでいてちょっと拍子抜けしたっていうのがヒトゲノム解読は全てコンピューターの進化による賜物なんですね、私は恥ずかしながら科学者が数式みたいなのを解いてやっているかと思っていました。 そしてセレラ社が急速にヒトゲノムを解読で国家を追い抜き、次の段階はその解読されたＤＮＡの配列から遺伝子を見つけ出しどんなタンパク質を作っているかつきつめる事らしいのですが、今度の研究でもやはりコンピュータの性能が上がれば上がるほど「遺伝子発見ソフトも含め」ゲノム研究は進むのでしょうか？ 例えば今使っているコンピュータの速度が１００倍ぐらいになればゲノム研究も１００倍とは限りませんが１０倍 ２０倍と比例していくのでしょうか？ 毎回教えてもらってばかりですいませんがとても気になります、回答よろしくお願いします。 薬と遺伝子(塩基配列)との関係 大分前になります。十五年くらい前になると思います。 遺伝子に強く興味を持ち、色々調べていた時期がありま した。また現在でも放送大学の講義で、時々聴講はして います。 このように、私個人は、専門家ではなく、シロウトです。 高校で、大学で理系の分野を専攻したくらいの程度の 知識の持ち主です。 サイエンスアイと言う、(現在はサイエンスZEROと言う 名称に変わりましたが)NHKのEテレで放映していた 内容が、今になって気になって来ましたのでお聞きします。 当時、サイエンスアイで、薬と遺伝子の関係について、 次のような内容で述べていた事を記憶しています。 大雑把な内容ですが、書いてみます。 本来は遺伝子の配列ではないが、遺伝子とは定義されて はいないが、ヒトゲノムには、Aluと言う配列が存在し、 ヒトによって、その配列の長さが異なり、この配列の 長さによって、薬の効き具合に違いが生じると言った 内容でした。 またAlu配列は、数個の配列が繰り返す配列と言った 説明でした。 体質的な問題に関わってくるとの解説でした。 まず、私の解釈が正しいかどうかお聞きしたいと思い ます。 そしてAlu配列の他にも、薬の効き具合に影響を与える 配列が、現在ヒトゲノムの中に見つかっているのでしょうか、 存在しているのでしょうか? 余談ですが、また最近年齢によっても、薬の効き具合に違い があると言った事が、テレビ等で報道されています。 この事は薬の副作用との大きく関係して来るようですね。 若い人は、年を取った人より、一般的に代謝能力が高いから、 薬の成分が、体内から、早く排出されやすいと言った事を聞きます。 ゲノムとプライマーの配列問題 今、考えている問題なんですが。 ヒトのゲノムはほぼ3*10^9bpである。10塩基からなるプライマーと相補的な配列が、この中にいくつ現れるか計算しなさい(2本鎖であることを考慮すること)。ただし、4種の塩基の存在確率は等しいものと仮定する。 これは題意として、いくつ現れるかといのは、期待値を聞いているのでしょうか？ また、そうだとしても、全く解くための方針が見つかりません。どなたかアドバイス頂けないでしょうか。 墓石を残さず、ゲノムの塩基配列を残す案 自分の先祖の墓石を維持・管理するのは、どういう意味があるのですか？自分のＤＮＡの中に、先祖のＤＮＡの、それぞれの部分が混在して生き続けているわけです。自分がこの世に「存在した証」が必要だとすれば、自分の墓石を残す代わりに、自分のＤＮＡのゲノムの塩基配列を記述して残すとすれば、何か問題がありますか？一族のＤＮＡの共通配列も明瞭になり、先祖と自分と間の親近感（魂の交流？）も増すのではないですか？昔は、ＤＮＡ・ゲノムのような技術・知見がなかったので、墓石（遺骨など）を残したのではないでしょうか？ 塩基配列の相同性の計算方法について こんにちは。 いま、卒業研究でウイルスゲノムの塩基配列の相同性を比較するという作業をしています。 ウイルス２０株間すべての相同性を出したいのです。 いまは、Ｇｅｎｅｔｙｘで一つ一つ計算しているのですが、とても手間がかかります。 一度に、多数の株間の相同性を計算してくれるようなフリーソフトをご存じでしたら教えていただけませんか？ よろしくお願いいたします。 ポインタと配列 配列を複数他の関数に渡す方法を知りたいです。１つの場合は、次でできました。 void sample2(int *a) { printf("%d",a[2]); } int sample1() { int a[]={0,1,2}; sample2(a) return(0); } sample1のなかにもっと多数の配列a1,a2,a3,....,ax,.... が存在する時に、それを他の関数にわたす効率のいい方法はありますか？基本的な質問かもしれませんがCの本が今手元に無かったので質問させていただきました。 ヒトゲノムの解析について 先日、中高校生のための講習会で、 第六回バイオインフォマティックス講習会「ヒトゲノム計画とインターネット」 というものに参加してきました。 そこで、基本的なことなのですがイマイチ分からなかったことをいくつか教えて下さい。（その場で聞けばよかったのですが聞き損ねました。） (1)DNA、遺伝子、ゲノム、この三つの定義 (2)ゲノムを解析する時には、DNAを細かくちぎって大腸菌の中に入れて培養させてそれを解析する、と聞いたのですが、何の為にDNAの数を増やすのですか？絶対数を増やして解析結果の正確性を上げるため？あと、ヒトのDNAと大腸菌のDNAはどうやって見分けるんですか？ヒトのDNAによって大腸菌が変異を起こしたりしないのですか？ (3)ヒトゲノム計画で解析されているゲノムは世界中の色んな人のものだと聞きましたが、それは何故なのでしょうか？世界で、一人のものを解析するとその結果はその人のゲノムであり「ヒト」のゲノムとしては平均的ではない、というのは分かるのですが色々な人のものを使う、というのはいまいちよく分かりません。そうすることによって平均的になるとは一概には言えないと思うのですが・・・。 宜しくお願いします。 これは日本語なのですか？ 最近、いろいろなメディアでとりあげられているこのことば。 「ヒトゲノム」。 ヒトという言葉はまぎれもなく、「人」であろうと思うのですが、これに「ゲノム」をくっつけた場合、日本語ではなくなるのでしょうか？万国共通の用語なのでしょうか？ それとも日本語として扱うのでしょうか？わかりません。ついでに意味もわかりません。 さらに、こうした用語はほかにもたくさんあるのでしょうか（日本語が万国共通語になった例）。「津波」は「TSUNAMI」として共通語になったとききました。 おしえてください。 日本史の転換点？：赤穂浪士、池田屋事件、禁門の変に見る武士の忠義と正義 OKWAVE コラム ゲノムプロジェクト(ヒトゲノム計画等)について こんにちは。 初歩的な質問ですが、ヒトゲノム計画などのゲノムプロジェクトによって解明された事には どんなことがありますか。 例えば (1)、「ヒトの場合、『TCAGACTA』という塩基配列であればこの固体は白髪だ」だとか 「『CGCGATTATAATAGC』という並び順であればこの固体は花が好きだ」などと言ったところでしょうか。 少し説明しにくいですが、科学者がその塩基配列を見れば、この固体は眼が青いな、等というふうに解ったり・・・。 (2)、それとも、塩基配列だけではやはり固体の特徴までは解らなく、もしそうだとしたら、 どこまでの情報が分かるのでしょうか。 (3)、それとも(1)でも(2)でもなく、僕の考えはやはり見当違いな考えでしょうか。 どなたかご存じの方いらっしゃいましたら、ぜひ宜しくお願いします！ ※非常に大ざっぱで適当な例です・・・。 身体的特徴の個人差について。 身体的特徴の個人差について興味があり、 ド素人ながら本を読んで調べています。 分子生物学的見地からすると、 まずヒトとしての特徴を決定づけるヒトゲノムがあり、 その中におよそ１０００分の１の割合で存在するヒトゲノム多型が 個人差を生むというところまで知りました。 しかし、手に取った書籍には多型と病気の関係についての簡単な記述しかなく、 容姿との関係を詳細に指摘するものにはまだ出会えていません。 そこで今回質問したいのは、まずヒトゲノム多型がどのようなプロセスで ヒトの身体的特徴を形成しているのかということです。 例えば、ある特定の文字配列が髪質の直毛やくせ毛などを決定するといった具合に、 できれば人種差などの大きな違いだけでなく、 ヒト全般に見られる細かい特徴差の範囲まで知りたいです。 勿論、自分は現在の研究がどこまで進んでいるかもわかっていないので、 可能性の示唆という次元でも構いません。 また、このような遺伝情報のみならず、 生後の環境も外見形成の一因であるとよく言われます。 自分はヒトゲノムが生前の影響要因、環境が生後のそれと大雑把に理解していますが、 両者が身体に作用するメカニズムについても何らかの知見を求めています。 それぞれの影響とは厳密にどう違うのか。 ゲノムによって指定された特質を環境の影響が（成人後に）凌駕することはあるのか。 そのときゲノムは書き換えられるのか、書き換えられないまま眠っているのか。 などなど。。 さらに、ヒトゲノム、環境以外に身体的特徴を決定づける要因はあるのか。 ということも疑問です。 以上の大まかに３点の質問について、 研究の進捗も含めて教えていただきたいと思います。 関連するものならばどんな些細な情報でも助かります。 質問が広範囲すぎる上に漠然としている気が自分でもするので、 参考になる書籍やウェブサイトなどの情報源を紹介していただくのが 一番手っ取り早いかもしれません。 自分は全くの初心者なので、 質問文自体に誤りがあればそれも遠慮なく訂正してください。 長々と失礼しました。よろしくお願いします。 ＮＣＢＩでの検索 ＮＣＢＩを検索するとＡＴＣＣ１１８４２の全ゲノムの解析がされているようで、非常に多数の遺伝子の塩基配列が出てきました。そこでなんですが、この場合、１６Ｓ-２３ＳｒＲＮＡスペーサー領域の塩基配列も分かるのですか？また、分かる場合は、その調べ方も知りたいです。よろしくお願いいたします。 ヒトの全塩基対とヒトゲノム ゲノム解読の意味が分からなくて困っています。 (1)ゲノムは「ある生物の遺伝子の全体」というような意味だと思いますが、それでほぼ正しいでしょうか。 (2)遺伝子は「生物の形質を子孫に伝える働きをするひとまとまりになった塩基対群」というような意味だと思いますが、それでほぼ正しいでしょうか。 (3)遺伝子はヒトのDNAの中に約3万個あるとお聞きしましたが、だいたいその程度の数あるのでしょうか。 (4)(1)～(3)が全て正しいとすると、「ヒトのゲノム」と「ヒトの全塩基対」とは、全く別のものであることになるように思うのですがそれで正しいでしょうか。つまり、「ヒトの全塩基対」の中のごく僅かの部分（つまり、遺伝情報を有する約3万カ所の部分）のみを「ヒトゲノム」と言うように思うのですがそれで正しいでしょうか。 よろしくお願いします。 配列の添削願 $dataという変数から配列を取り出すとき もしも中身が空なら0を代入したいです。 $a = $data[$i]; //$data内の$iのデータを取り出す if($a==""){ $a=0; }//$iが空もしくは存在しない場合0を追加 echo $a; こちらの文章で$aの中には文字列もしくは 存在しないかデータが空の際は0が表示されるでしょうか？ 今、配列の中身が空や\nのとき0を入れたいがうまくいかず困っています。 沢尻会、どんなものなのでしょうか？ 最近、舞台挨拶での態度で、沢尻エリカさんが話題になっていますが、たまにニュースで「沢尻会」という言葉を耳にします。 いろんな女優さんの集まりのようですが、具体的にどんな会なのでしょうか？ イメージとしてあまりよくない会のように見えますが、それもどうなのか気になっています。 また、本人は存在を「どうなんでしょう？」とにごしているそうですが、実在するのでしょうか？ あまり知らないので、文の中で違うんじゃないか？と思うところがあればご指摘していただきたいです。 ご存知の方がいれば教えて欲しいです。 配列や連想配列について 言語一般の配列や連想配列について 最近どういう解釈をしていいのか わからなくなってしまいました。 仮にPerlで話をさせてもらいますと、 連想配列%FORMがあるとき、 個々の要素にアクセスする場合 例えば$FORM{'name'}などと記述しますが、 この$FORM{'name'}を みなさんはどのように解釈しているでしょうか？ $FORM{' '}にキー nameを 代入しているようなイメージで、 「連想配列%FORMからキー'name'の値を取得する」 という考え方でしょうか？ わたしは最近、 $FORM{'name'}はそれ自体が一つの変数という 考え方が出来るのではないかという気がしているのですが、 連想配列の実装から考えると この考え方は正しいのでしょうか？ 以前、配列について同様の質問を したことがあります。 例えばC言語でint a[100]と宣言した場合は、 連続的なアドレスに確保されるため、 a[2]はaという名前のアドレスから a + 2 番目の場所という意味になるが、 言語によっては不連続なアドレスに 確保されるため、a[2]は一つの変数名として 考える必要がある・・ との回答でした。 ならば連想配列の場合も もし不連続なアドレスに確保されるならば、 $FORM{'name'} は一つの変数名と 考えたほうが正しいのではないかと 思ったからです。 連想配列の内部的な処理がどうなっているのか 教えて頂きたいです。 よろしくお願いします。 人間の寿命についてのヒトゲノムの書き換え ヒトゲノムはすべて解読されているそうですが、 それでも不老不死やすごい長寿は難しいのでしょうか。 例えば、ゲノムの中に、老化や寿命に関する部分があるとして、 「老化する、寿命は百年ぐらい」となっている部分を、 「老化しない、寿命は千年ぐらい」とか書き換えるだけでは ダメなのでしょうか。 もちろん字ではなくDNA的に。 臓器が持たないかもしれませんが、 交換しながらとか。 注目のQ&A 「You」や「I」が入った曲といえば？ Part2 結婚について考えていない大学生の彼氏について 関東の方に聞きたいです 大阪万博について 駅の清涼飲料水自販機 不倫の慰謝料の請求について 新型コロナウイルスがもたらした功績について教えて 旧姓を使う理由。 回復メディアの保存方法 好きな人を諦める方法 小諸市（長野県）在住でスキーやスノボをする方の用具 カテゴリ 学問・教育 自然科学 理科（小学校・中学校）化学物理学科学生物学地学天文学・宇宙科学環境学・生態学その他（自然科学） カテゴリ一覧を見る OKWAVE コラム 突然のトラブル？プリンター・メール・LINE編 携帯料金を賢く見直す！格安SIMと端末選びのポイントは？ 友達って必要？友情って何だろう 大震災時の現実とは？私たちができる備え 「結婚相談所は恥ずかしい」は時代遅れ！負け組の誤解と出会いの掴み方 あなたにピッタリな商品が見つかる！ OKWAVE セレクト コスメ化粧品 化粧水・クレンジングなど 健康食品・サプリ コンブチャなど バス用品 入浴剤・アミノ酸シャンプーなど スマホアプリ マッチングアプリなど ヘアケア 白髪染めヘアカラーなど インターネット回線 プロバイダ、光回線など
