ゲノムとプライマーの配列問題

質問

今、考えている問題なんですが。

ヒトのゲノムはほぼ3*10^9bpである。10塩基からなるプライマーと相補的な配列が、この中にいくつ現れるか計算しなさい(2本鎖であることを考慮すること)。ただし、4種の塩基の存在確率は等しいものと仮定する。

これは題意として、いくつ現れるかといのは、期待値を聞いているのでしょうか？
また、そうだとしても、全く解くための方針が見つかりません。どなたかアドバイス頂けないでしょうか。

回答No.3

noname#227064

> ACGTTGAという配列のプライマーはAGTTGCAという配列のプライマーと同義である

これが、
5'-ACGTTGA-3'
3'-AGTTGCA-5'
を意味するならあなたの考えのとおりですが、
5'-ACGTTGA-3'
5'-AGTTGCA-3'
なら同じではありません。

回答No.2

owata-www

＞プライマーってのは前後対称なものは一つと数えていいんですよね？

とは？

ちなみに、問題は期待値を聞いています

補足

すいません。なんか的外れなことを言っているのかもしれません。

自分が考えているのは例えば、「ACGTTGAという配列のプライマーはAGTTGCAという配列のプライマーと同義である」ということです。
こういった考え方自体正当なのか自信がないんですが。

回答No.1

Tacosan

期待値なんだろうなぁ. 「10塩基からなるプライマー」が何通りあるかはわかりますか?

補足

プライマーってのは前後対称なものは一つと数えていいんですよね？

もしそうなら、
4^10-4^5=1047552(通り)

もしそうでないなら、
4^10=1048576(通り)

じゃないかと思います。