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※ ChatGPTを利用し、要約された質問です（原文：DNA塩基配列の「相同性」？）
DNA塩基配列の相同性についての計算と解釈
このQ&Aのポイント
- DNA塩基配列の相同性を判定するためには、既知の生物種の配列と調べたい配列の一致率を計算します。
- 一般的に、一致率が99％以上の場合は同じ生物種か極めて近縁な種と判断されます。
- 一致率を示す際には、塩基配列のホモロジーという用語が使われることもありますが、ホモロジーと相同性は同じ意味で使用されます。
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質問者が選んだベストアンサー
● 99％以上の確率で相同性を示した というのは、おそらく、ある配列Ａに類似した配列をデータベースの中を検索し、その結果見つかった既知の生物種の配列Ａ’が、配列Aと偶然一致する確率が 0.01よりも小さいことを意味しています。この場合の確率というのは、あるデータベースを検索した時の結果を評価する値です。具体的にどのような計算をしているのかは、私はよく知りません。以下の参照URLの Expect (E) valueについて調べることは、参考になるかもしれません。 ●長さ900塩基のうち、調べたい配列と既知の配列が892個は一致していた というのは、二つの配列間（ＡとＡ’）の関係についてだけ、述べています（データベースの検索結果とは関係なく）。二つの配列を比べた時、塩基配列間で99.1%が一致しており、これらは配列類似性が高いという使い方をしますね。 ●相同性は質的性質（ある/なし） 二つの遺伝子が「相同である」というのは、二つの遺伝子が「共通の遺伝子から派生している」という意味です。共通遺伝子から派生した遺伝子群は、配列類似性が高い場合が多いですが、その逆は言えません。つまり、二つの遺伝子間の配列類似性が高くても、共通遺伝子から派生した遺伝子（相同性である）とは限りません。配列類似性が高くても、別々の独立した遺伝子からそれぞれが派生した場合もありえます。
お礼
回答ありがとうございます。 やはり統計的な処理を経て言っているのですね。あまり得意な分野ではないですが、教えていただいたサイトなどを読み、勉強してみます。