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蛋白のLC-MS用サンプルについて

免疫沈降後に得られた蛋白についてLC/MS/MSでの同定を行っています。 免疫沈降後にSDS-PAGE⇒銀染色⇒切り出し・ゲル内消化⇒MS解析という手順で行っています。 しかし、サンプルによってはCBB染色でバンドが確認できるので、CBB染色の状態でバンドを切り出し、Trypsinによるゲル内消化を行おうと思っているのですが、可能でしょうか? クマシー染色のバンドを切り出してチューブ内で脱色⇒ゲル内消化とも考えているのですが・・・・。 初心者なので、あまり詳しくないので、初歩的な質問かもしれませんが、よろしくお願いいたします。

質問者が選んだベストアンサー

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  • dolphino
  • ベストアンサー率46% (56/121)
回答No.2

教科書や各社のカタログを参考にしてください。 一般的には「銀染サンプルからでも出来るがその場合には、、、」という注意事項が書かれているものです。CBB染色が基本です。

vvv_chiho_vvv
質問者

お礼

ありがとうございました。 銀染色からしかやったことがなかったので・・・。 教科書、きちんと読んでみます。 ありがとうございました。

その他の回答 (1)

  • owata-www
  • ベストアンサー率33% (645/1954)
回答No.1

特に問題ないかと(何を心配されているかわかりませんが…)

vvv_chiho_vvv
質問者

お礼

基本はCBBだったのですね。 銀染色をするのが私のところでのスタンダードだったので、クマシーでやっているとは知りませんでした。 まだまだ勉強が足りないようです。 ありがとうございました。

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