ゲルシフトに関して

質問

申し訳ありません自分自身の勉強不足だとは思うのですが抗体を用いて行うゲルシフトがわかりません。
普通ゲルシフトは特定のDNA断片を入れ核蛋白質などと混合、すると普通に蛋白質のみを流した時とは違い、DNA結合蛋白質があればDNAと結合した蛋白質が移動度の変化によりスーパーシフトをおこすというのはわかるのですが抗体を用いなくても出来ると思います。
ではなぜ抗体を用いてゲルシフトをやることがあるのでしょうか？？

回答No.2

ga111

「DNA結合蛋白質が実際にその蛋白であるかどうか？」はそれに対する特異的抗体でスーパーシフトがおき、ネガティブコントロールの抗体でスーパーシフトがおきないという事実でより確実に示せるからです。

回答No.1

owata-www

ちょっと質問を勘違いしているかもしれませんが…
染色（ラベル）するのはDNAとタンパク質どっちですか？

前者の場合は、大体やらなくても見えます。ただし、より移動度を小さくすることが出来るので（よりシフトする）、抗体を用います。
後者の場合は、大体あまりシフトの様子が見えないので（私の経験上）、抗体を用いてシフトを見ます。