ショウジョウバエの遺伝子型の表記について教えてください。

質問

ショウジョウバエについて素人なので、論文を読んでいて遺伝子型の表記がいつも良くわかりません。なんとなくは理解できるのですが、、

論文にこのような表記がありました。
w; hsGal4/+; UAS-dFOXO/+
この掛けあわせで、hs-Gal4/UAS-dFOXOのF1が出来るのはわかるのですが、wは野生型のことなんでしょうか？あと「；」や「,」、「/」はどのようなときに使われるのでしょうか？
煩雑な文章になってしまいましたが、どんぞよろしくお願いします。

回答No.2

geneticist12 · ベストアンサー

/は相同対を表します。hsGal4/+だと相同染色体の一方にhsGal4が乗っていてもう一方がその遺伝子について野生型（この場合はtransgene hsGal4が入っていないということ）のヘテロ接合であることを表しています。
;は遺伝子型が複数の染色体にまたがるとき、染色体の区切りを表します。

この場合、第一染色体（X染色体）がw、第二染色体がhsGal4/+、第三染色体がUAS-dFOXO/+の遺伝子型です。

wはw (white)遺伝子のmutantである遺伝子型を表しています（なぜこれを入れているかはNo. 1さんの通り）。ショウジョウバエではホモ接合体、あるいはX染色体のヘミ接合体（つまりオス）の場合は相同対をw/wのように/で表さずに、wのみで良いことになっています。この場合、X染色体ですからメスw/w、オスw/Yを意味します。

,は特定の染色体名、染色体異常を表す記号に、その染色体上の遺伝子型を続けるときの区切りとして使います。TM3, Ser （TM3: 第三染色体のバランサー名、Ser: それに乗っているマーカー遺伝子）とか、In(1)dl-49, v f (In(1)dl-49: 第一染色体の逆位染色体名、v f: それに乗っているマーカー遺伝子）のように。大昔は同一染色体の複数の遺伝子型を列記するときに「,」が区切りに使われたこともありますが（v, f　のように）、この使い方は現在ではされず、区切りはスペースで表すことになっています（v fのように）。

>この掛けあわせで、hs-Gal4/UAS-dFOXOのF1が出来るのはわかるのですが、
その表記だと、第二上の遺伝子hs-Gal4と第三上の遺伝子UAS-dFOXOが相同対になっていることになって変です。両方の遺伝子を同一個体に持たせることによってworkさせようとしているのだと思いますが、w; hsGal4/+; UAS-dFOXO/+の状態ですでにそうなっています。

参考URL：

http://flybase.org/static_pages/docs/nomenclature/nomenclature3.html

お礼

大変わかりやすい説明ありがとうございました。
とても助かりました。
F1の記載については私の勘違いでした。

回答No.1

noname#71020

「w; hsGal4/+; UAS-dFOXO/+
この掛けあわせで、hs-Gal4/UAS-dFOXOのF1が出来るのはわかる」
のあたりの意味がよく汲み取れないのですが…

ショウジョウバエは、4染色体持っています。
主に機能しているのは３染色体であるので、それぞれの染色体I、II、IIIの３染色体を
I ; II ; IIIの順で記します。
ショウジョウバエは2nですので、相同染色体を２本セットで持ちます。
母親由来と、父親由来の染色体のセットです。
a/a ; b/+ ; +/+　
という遺伝子型の場合、
第一染色体にaという遺伝子型をホモでもつ
第二染色体にbという遺伝子型をヘテロでもつ（つまり、相同染色体の一方のみがbをもち、もう一方は野生型である）
第三染色体は、どちらの染色体も野生型であることを示します。

ちなみに、性染色体はI染色体です。
♂の性染色体はyであらわす、あるいは他の記号を使うこともあります。
w/y ; a/a ; +/+だと、♂です。

,は、特別な意味ではなく、普通の使用法と同じだと思います。
a,c/+ ; b/+ ; +/+
だと、第一染色体にaとcの遺伝子型を持つことを意味します。

また、２匹のハエを掛け合わせを特に記す際には、上記のような記号を用いて
遺伝子型×遺伝子型
で表記します。

wは、white遺伝子機能の欠失の遺伝型を示します。
多くのトランスジェニックフライは、whiteバックグラウンドのハエに、white遺伝子をマーカーとして利用して樹立されています。
つまり、white遺伝子が働かないwハエ（白眼）に、white遺伝子と、目的の遺伝子配列を導入します。
赤眼になったハエを見分けることで、トランスジェニックフライを選び出すことができます。

お礼

とても丁寧に教えていただき、ありがとうございました。
大変よくわかりました。
F1の記載については私の勘違いでした。