SDS PAGEで使用するゲルの組成について

質問

現在Laemlli法でSDS PAGEポリアクリルアミド電気泳動を行っているんですが、ATTOの説明書のゲルを作る組成でSDSが含まれていません。他の実験プロトコールの本を読むとSDSが含まれています。このSDSはなんのためにいれるのでしょうか？なくても影響はないのでしょうか？

回答No.4

Fiorina

ほとんどのプロトコルではSDSが入っていますが、実はSDSは試料に入っていればゲルにいれなくてもよいのです。一応いつも入れていますが、入れなくても結果ほとんど変わりません。

回答No.3

ootsu

>試料はタンパク質
電気泳動で、タンパク質の何を分析しようとしていますか？
そのタンパク質は、既知のものですか？未知のものですか？
どういうユニットが考えられますか？
実験する前に仮説を建て、ある程度、結果を予測しながら実験は
進めていくものです。

ということで、SDSをゲルに含めた場合、バッファーに入れた場合
試料のみSDS化した場合と、実験結果は異なってくるはずです。

がんばって実験してください。

回答No.2

ootsu

繰り返し、補足ですけど、ゲルにもSDSを入れる場合があるのは何故か？どんな影響があるのか？　これは、SDS-PAGEの本質みたいなものですから、ぜひ考えて、実験して覚えてください。

ちなみに、分析対象（試料）は、何ですか？

補足

回答ありがとうございます。試料はタンパク質です。ATTOのホームページからDLできるファイルには確かにSDSが含まれていました。今回私が見たのはATTOの泳動装置に付属していたと思われるマニュアルです。そこには泳動バッファーにSDSが含まれていれば、ゲルにSDSを入れなくても同じSDS PAGEになると書かれていました。

回答No.1

ootsu

何を電気泳動で分析しますか？そして　何を知るために分析してますか？

>なくても影響はないのでしょうか？
目的がわかっていれば、こんな考えは、浮かばないはず。
SDSを何のために入れるのかも講義で教えているはずです。
あるいは、それが課題かも。

ATTOの説明書では、ゲルを作る組成にはSDSが含まれていませんね。
B液にSDSが含まれてますよね？どういう順番でゲルおよび試料等を
混合していくか理解していますか？