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westernの際のタンパク量
いつも、10wellのゲルを使い、通常総タンパク量25μgをアプライしています。 今回cell lysateを作り濃度を測ったところ、いつもより半分程度の濃度しかありません。 よって、アプライするタンパク量を減らしてみたいと思うのですが、皆さんは10wellのゲルですと、最低どのくらいのタンパク量をアプライされますでしょうか。
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検出系による違いはあると思いますが、ECL+という発色系で、哺乳動物のCell Lysate,50ng/wellまで希釈しても、ある種の酵素蛋白がDetectionできた経験があります。 もっと感度の高い検出系があれば、さらに薄めても大丈夫かも。Cell Lysate なので、pgオーダーはさすがに厳しいと思いますが。
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- happy-engawa
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#1のものです。 もし、ECL+で検出できなかったら、ピアス社の"SuperSignal West Femto Maximum Sensitivity Substrate”をお奨めします。 参考URLを載せておきました。ECL+と比べて、非常に高感度であることが分かると思います。 感度がぜんぜん違います。ECL+の感度では、見えないバンドでも簡単に検出できます。 もちろん、第一に抗体の特異性が高いことがなにより大事ですが。
お礼
再度ご回答いただき、ありがとうございました。 #2さんからご回答をいただいた後、10ugでトライしてみたところ、バンドが検出できました。 しかし、こういう試薬の存在を知りませんでしたので、大変勉強になりました。 ありがとうございました。
- happy-engawa
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スタンダードカーブを作りたかったので、 50, 25, 12.5. 6.25, 3.125μgと希釈して、アプライしたことがあります。もっと、少ない量まで希釈したこともあると思います。 大丈夫かどうかは、 1.目的のタンパクがどのくらいサンプル中にあるか? 2.どんな検出法で検出するか? ということです。 これは、ケースバイケースなので、自分の実験系で、どこまで少なく出来るか自分で予備実験をやりましょう。一度やれば、本試験を自信をもってやれますよ。
お礼
ご回答ありがとうございました。 いずれやりたいと思いますが、今回は回収できたタンパク量が少なく、十分な量をアプライできないのです。 そこで、どれくらい少なくできるか、と思ったのです。 次善の策として、濃縮してみようかとも思ってるのですが。 ボスは、そのようにした蛋白では、westernはあまりうまくいかない、と言うのですが。
お礼
ありがとうございます。 私どもが使っているのもECL+です。 細胞は、ヒトの癌細胞です。 目的とする蛋白は、リン酸化蛋白です。 10μgぐらいはアプライできそうなので、十分ですね。 濃縮せず、そのままトライしてみようとか思います。