ゲノムアイランド、説明に使われているグラフの意味が良く分かりません。

質問

ゲノムアイランドについて、ゲノムアイランドとは
他の菌から転移してきたDNA領域との説明を受けました。

そして、ノートにグラフを書いて転移領域を示されたのですが
このグラフの意味が良く分かりません。

グラフを見ると、下方に顕著に突起した緑色の領域が
転移領域であり、この部分は外来遺伝子領域であることが
漠然と分かりそうなのですが、正確に見ていくと良く分かりません。

・X軸は具体的に何を示しているのか？正の位置がアデニンとチミン、負の位置がグアニンとシトシンとありますが
各々の何を表しているのか？含有量？？

・Y軸は何を表しているのか？DNAの塩基配列を末端から
番号を振っていき、その番号を表しているのか？
だとしたらYの最終値はDNAの塩基配列の数？

・そもそもこのグラフは何を示しているのか？

X軸とY軸の定義（上２問）が明らかになれば、分かるとは思うのですが。。。
多分染色体のATCGの分布を示しているかもしれませんが、
X軸とY軸が正確に何を示しているのかわからないので
グラフの意味が良く分かりません。

要は、X軸とY軸について教えていただければ
その後は考えて見ることが出来ると思うのですが、、。
もしご存知の方がいましたらお願いします。

回答No.1

ice_rif

Ｘ軸はＤＮＡのＧＣ含有量（％）だと思います。Ｙ軸はＤＮＡ塩基の番号で、細菌なら普通oriCを１としてぐるりと１周です。

ある生物のゲノムを見るとＧＣ比は全体的にほぼ同じ値になります。その中で偏りのある値が続く領域を外来のＤＮＡとする考え方があります。

お礼

考えたところ、X軸の意味がやはり分かりません…。
GCの含有量として、何の、何に対する含有量なのか？

ある生物に対して複数のサンプルを用意して、
それぞれの個体のDNAを調べ、そのDNAにおいて
塩基配列を調べていき、一番目塩基配列において
CGであるDNAの割合、としか想像つかないのですが、
だとしたらグラフは間違っていると思いますし、、。

確実に納得できないので先生に聞いてみようと思います。

回答ありがとうございました。