ベストアンサー 分子動力学のソフト 2020/10/25 17:10 分子動力学シミュレーションを独学で学ぼうとしています。世の中で普及していて、かつフリーのソフトでおすすめを教えてください。分野は樹脂などの材料の開発です。 みんなの回答 （1） 専門家の回答 質問者が選んだベストアンサー ベストアンサー nananotanu ベストアンサー率31% (714/2263) 2020/10/26 15:23 回答No.1 https://ma.issp.u-tokyo.ac.jp/app-category/category3?apo=1&order=DESC 通報する ありがとう 0 カテゴリ 学問・教育自然科学科学 関連するQ&A 分子動力学シミュレーションについて 分子動力学シミュレーションでは、荷電粒子の間の相互作用としてローレンツ力が考慮されていないと思うのですが、考慮する必要はないのでしょうか？ 分子シミュレーションについて 分子シミュレーションで、ブタンの構造最適化、エチレンの振動解析、長鎖アルカンの分子動力学シミュレーションをおこないました。 これらの結果に関して考察をしようと思うのですが、分子シミュレーションの結果に関してどのようなことを考えるべきなのか思いつきません。一般的にどのようなことを考えればよいのか教えていただけないでしょうか？ 分子動力学シミュレーションについて 研究をすすめていく過程で、どうも分子動力学シミュレーションを使った方がよさそうな流れになってきました。 この計算は、大型計算機でのみ可能なのでしょうか？ 自宅のＰＣでできると非常に楽なのですが‥‥。 また、大型計算機を借りて行う場合、 費用がどの程度なのか、おおよその値段が知りたいです。 ただ、この計算手法についてふと思うのですが、 要は個々の原子分子のポテンシャルエネルギーなどを考慮して 衝突などの素過程が計算されていくのだと思うのですが、 衝突断面積やポテンシャルエネルギーが正確に求まっていない原子分子を計算に用いる場合、 結果は信頼性の低いものになってしまわないかという危惧があります。 そして正確な衝突断面積など、極一部の原子分子についてしか求まっていない現在、 この計算手法の正確性とはいかなるものなのか、 そのあたりのご意見も頂ければ幸いです。 宜しくお願い致します。 分子動力学で結晶の再現 分子動力学のシミュレーションで結晶構造の再現はできるのですか． 例えば、液体状態から金属が凝固するときにちゃんとその金属本来の 結晶構造になるかどうかや、温度で結晶構造を変える金属が ありますが、結晶構造の温度変化を記述できるような 正確なポテンシャルで再現をしたという研究はあるのでしょうか． ご存知の方いらっしゃいますか． 分子動力学計算ソフトtinkerのコンパイルについて。 分子動力学計算ソフトtinkerのコンパイルについて。 現在、計算化学の研究で分子動力学計算ソフトの"tinker"を用いて研究をしようとしています。 tinkerのフォルダーを自分のパソコン（Windows）にダウンロードし、リモートサーバー（Linux）上でコンパイルし、実行できるようにしたいのですが、コンパイルのやり方が分かりません。 自分で調べてみると、tinkerのフォルダーにはMakefileというスクリプトファイルのようなファイルがあり、その中を書き換えたりする必要もあるみたいなのですが、その辺も分かりません。 どなたか分かる方が居ましたら教えてください。Linuxでの具体的なコマンド操作から示して頂ければ幸いです。 分子シミュレーションにおける制限について パソコンで分子シミュレーションをするとき（モンテカルロ法や分子動力学法） 粒子を任意に配置してシミュレーションを始めますか？ そしてもし任意に配置するとしたら、実際の系との間に誤差や変化が生まれるのでしょうか。 宜しくお願いします。 高分子材料の実例 高分子材料はいかなる分野で使われているのでしょうか？ 実例を出来るだけ詳しく教えて下さい。 そして、なぜその分野で有用なのかを教えていただければありがたいです。 分子のエネルギーの計算式 いつもお世話になってます。 突然専門分野でない問題を与えられていまいち理解できなかったので質問させてください。 問題は分子は結合する角度、距離によってエネルギーが違うのでエネルギーが最小になるような角度を遺伝的アルゴリズムや最急降下法で求めるという内容です。 化学はさっぱりなので図書館なので調べたところエネルギーを求める方法は分子軌道法、分子動力法ある所までわかったのですが、調べた物はすべてツールを使用しており計算式が載ってません。 そこで質問なのですがエネルギーを求める式は自分で作るものなのでしょうか？ 分子軌道計算法について 分子軌道計算法について 独学で分子軌道計算について勉強したいと考えていますが、知人に「独学では無理。間違いに気付かず正確な計算ができない」と言われました。 私自信、いままで分子軌道計算のソフトすらろくに使ったこともなく、そう言われるとしり込みしてしまいます。 そこで、分子軌道計算法について初心者でも理解できる本やサイト、あと計算のソフトについてご教授願えませんか？ よろしくお願いいたします。 物理のシミュレーションソフト 幾何非線形および材料非線形が扱えて、 弾性および弾塑性材料のものを時刻暦解析することが可能なソフトウェアである物理現象をシミュレーションしたいと考えています。 安価であることが条件で、 できればフリーソフトがべストですが、 何かご紹介いただけないでしょうか。 よろしくお願いいたします。 コンパウンドメーカーを探しています。 いきなり樹脂（PE）の代替を任されました。 まったく高分子材料の素人で勉強してるのですが、こんな私と代替樹脂を作り出してくれるメーカーさんはいらっしゃらないでしょうか。 会社にもとくにコンパウンドに詳しい先輩はいません。新しい分野で技術を残したいということで上司に頼まれました。 今までは、業者丸投げだったようです。 どうかお願いいたします。 分子模型＿大学生 こんにちは。 化学科の大学一年生です。 学校の有機化学の授業で、分子模型を購入するように指示されました。 自分でもいくつかさがしてみたのですが、どうも何を基準にすべきか分かりません。 いきたい研究室も確定しているわけではなく、有機に行く可能性もあれば、 違う分野に行くかもしれません。 お勧めの分子模型などあれば一緒に示していただけるとなおありがたいです。 よろしくお願いいたします。 PDF変換ソフトの開発 PDFへ変換するソフトは世の中にたくさんあるのですが、どのようにして開発しているのでしょうか？ adobeからsdkを購入して開発しているのでしょうか？それとも、フリーの何かがあるのでしょうか？ フリーで環境が整うのであれば作ってみたいと思っています。 .tifファイルをPDFへ仮想プリンタを介さずに、バッチ処理できるもの考えています。 よろしくお願いします。 あなたの一押しのフリーソフトは？ 『企業やネットが星を被い電子や光が巡っても…ry』とは有名な文句ですね。ネットは広大です。それ故、有志が開発するフリーソフトの進化が著しい世の中になりました。中には製品ソフト顔負けのフリーソフトもあります。あなたの一押しのフリーソフトを名称と用途と共に紹介してもらえないでしょうか。 返答お待ちいたします。 MEMSシミュレーションに必要な知識 過去FEMによる数値解析を、構造解析応用メインで勉強指してきました。 今後興味のある分野として、MEMSデバイス(センサー等)のシミュレーションを考えています。そこで必要となる知識を教えて頂ければ幸いです。分子動力学や量子力学の知識も必要になるのでしょうか？ 概要だけでもアドバイス頂ければ幸いです。 超分子材料と太陽電池の関連性について こんにちは。 太陽電池には高効率な励起エネルギー移動、電荷移動、イオン対形成、再結合の抑制、フリーキャリヤの生成が必要です。 しかし、これが、どのように発電効率の向上につながり、これらに、超分子材料が寄与していくのかがわかりません。 超分子は２つ以上の分子が共有結合以外の結合で連結され１つの分子として挙動するものと定義されていますが、どのように関連あるのでしょうか。 授業でやったことなのですが、先生が非常勤でめったに会えないので、よければ、教えてください。 食器等の開発ソフトに関して教えて下さい。 グラスや食器等の開発、シュミレーションをするソフトはどのようなものがあるのでしょうか？ねじったり、３次元にできる機能があれば最高です。形やデザイン等を考えないといけないことがあり、質問させて頂きました。本格的な設計開発でないため、格安なソフトがあれば助かるのですが・・・ 高分子を学んでいる新2年生です。 今、大学の高分子工学科にいるのですが、来年に向けて、長い春休みに数学を予習しておきたいなと思うのです。数学は好きだし、女子なので数学で少し先をいけたら得だなと思っていて・・・。フーリエ解析をやると物理の計算が楽になるとか聞いたのですが、やっぱフーリエ解析でしょうか。これは予習しとくといいという数学の分野を教えてください。また、フーリエ解析のほかに力学を勉強しておこうとも思っています。独習できそうなお勧めの参考書がありましたら、なにとぞ教えてください。 樹脂材料について勉強したい。 射出成形でプラスチック製品を作るメーカーに勤めて3年目になる者です。 現在、樹脂材料について個人的に勉強している最中なのですが、樹脂材料の 化学式と、樹脂毎の特徴を頭の中で結びつける事が出来ません。 （化学の知識としては、H He Li Beが言える程度です。） そこで、 1）樹脂材料に出てくる化学式・基・環など、樹脂材料の物性に影響する分子 や分子構造が初心者でも分かる本 2）樹脂材料の化学式と特徴が結びついて説明されている本 1～2を網羅している本はありますか？ もちろん、1or2のどちらかに特化したものでもいいので、何かオススメの参考書があればご紹介ください。よろしくお願いします。 翻訳ソフト 和文→英文 に関して 翻訳ソフトを探しています。内容は技術開発情報、つまり理工系の分野です。和文→英文に訳したいのですが、お勧めのソフトはありますでしょうか？無料、有料、両方の情報が欲しいです。 とても困っています。よろしくお願いいたします。 注目のQ&A 「前置詞」が入った曲といえば？ 新幹線で駅弁食べますか？ ポテチを毎日3袋ずつ食べています。 優しいモラハラの見抜き方ってあるのか モテる女性の特徴は？ 口蓋裂と結婚 らくになりたい 喪女の恋愛、結婚 炭酸水の使い道は キリスト教やユダヤ教は、人殺しは地獄行きですか? カテゴリ 学問・教育 自然科学 理科（小学校・中学校）化学物理学科学生物学地学天文学・宇宙科学環境学・生態学その他（自然科学） カテゴリ一覧を見る あなたにピッタリな商品が見つかる！ OKWAVE セレクト コスメ化粧品 化粧水・クレンジングなど 健康食品・サプリ コンブチャなど バス用品 入浴剤・アミノ酸シャンプーなど スマホアプリ マッチングアプリなど ヘアケア 白髪染めヘアカラーなど
