タンパク質構造の用語に関して

質問

タンパク質に関する用語で、
・モチーフ
・ドメイン
・ファミリー
という３つがよく参考書などに出てくるのですが、いまいちそれらの違いが掴めません。
二次構造＝モチーフ、三次構造＝ドメイン、似た配列を持つタンパク質群＝ファミリーだと思っていたのですが、どうも違うようで…
よろしくお願いします。

回答No.1

otx · ベストアンサー

詳しくはwikiでタンパク質ドメインを検索してみてください。

簡単に言うと

ドメイン＞モチーフ

です。

ドメインの方がモチーフより大きな領域を指すものです。

例えば
Aドメイン中にあるBモチーフ、とは言いますが、

Bモチーフ中にあるAドメイン、とは言いません。

ドメイン＞モチーフなので、モチーフは二次構造を示すというより
小さい領域を示すことが多いので、結果的に二次構造を示しているように見えます。

ドメインは大きい領域を示すので、三次構造を示しているように見えます。

なので、
二次構造＝モチーフ、三次構造＝ドメインという定義ではないと思います。結果として、そうなっているということです。

ファミリーについては、その理解でいいと思います。

お礼

やはり違ったのですね…

ありがとうございました！