体の中の微生物
先日知り合いが、風邪を引いたのですがウィルスが脳に入ってしまい、３ヶ月近くも意識不明の重体となりました。また、以前いとこの子どもがやはり脳にバクテリアが入ってしまい、髄膜炎になったことがあります。幸いにも二人とも一命は取り留めましたが、身体に入った微生物について教えて下さい。
胃の中には１００兆個もの細菌が居ると言われますし、また、手のひらには５００万種にも及ぶ微生物がいると聞いたことがあります。
ウィルスは細胞の中に入れば、何万倍にも増殖するそうですし、バクテリアの増殖速度も、条件が良ければものすごいそうです。
こうした数字からすると、人間の体の中は、あっという間に微生物だらけになりそうですが、そもそも、人間の体の中では、
（１） バクテリアなどは胃などの消化器官の中だけに存在していて、そこから、血管や内臓、またはその隙間などに入る事はないのでしょうか？。または、入られたら、病気になると言うことでしょうか。
（２） 通常、消化器官の中にいる微生物は、そのほとんどが人間にとって無害である、または、共生関係にあると考えて良いのでしょうか。
（３） （２）とは逆に、病原性のバクテリアが胃の中に入った場合、他の膨大な数のバクテリアとの競争関係（？）があり、その中で生き残った物が、悪さをする・と考えて良いのでしょうか。
（４） 肺の中も外界と直接つながっていますが、やはりバクテリアが存在するのでしょうか？
長い質問ですが、よろしくお願い致します。
お礼
ありがとうございました。 助かりました。