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マイクロアレイデータからの遺伝子の絞り込み

マイクロアレイ解析超初心者です。 データを解析する際、膨大な遺伝子リストの中から、たとえばキナーゼ、転写因子、膜タンパク、分泌タンパク、などで遺伝子群を分類したいのですが、そのようなことは可能なのでしょうか?また、可能であれば、その方法を教えていただけますでしょうか? マイクロアレイ解析の経験がなく、データだけがあるのですが、右も左もわからない状態です。 ラボのPCには、dChip(フリーソフト)とDAVID(web)があります。 解析ソフトにお金をかけられないので、これらか、他のフリーソフトで解析できる方法をさがしています。 マイクロアレイについての知識も乏しく、おかしなことを言っているかもしれませんが、わかる方がいたらよろしくおねがいします。

みんなの回答

  • otx
  • ベストアンサー率44% (256/576)
回答No.1

まずは身近な研究室の諸先輩に指導してもらうことをお勧めします。 さて、マイクロアレイでは、素性の知れた(転写因子であるとか、まくタンパク質をコードしてるとか)遺伝子を貼付けてありますよね? そこに、自分のサンプルをふりかけて、くっつき具合を蛍光とかで検出するというものです。 何がどんな順番で張り付いていると分かっている基盤を使うものですので、 >膨大な遺伝子リストの中から、たとえばキナーゼ、転写因子、膜タンパク、分泌タンパク、などで遺伝子群を分類したいのですが、そのようなことは可能なのでしょうか? どのようなことを想定されているかよくわかりませんでした。 参考 http://ja.wikipedia.org/wiki/DNAマイクロアレイ

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