レポーターアッセイ

質問

今度、前任者の引継ぎでプロモーターアッセイを行うことになりました。（ただ、引継ぎと言っても、前任者は大分前にいなく、サンプルと僅かな資料が残っているだけです。）
質問なのですが、転写の実験などでよく“－○○bp～＋○○bp”という表記を見ますが、この“－”はどこを基準にとっているのでしょうか？
私は転写開始点だと思っていたのですが、どうやら前任者の方は翻訳の開始点（ATG）を基準にしていたようです。
どちらが正しいのでしょうか？それとも正確な規定というのは無いのでしょうか？よろしくお願いいたします。

回答No.1

otx

転写開始点を０としたら、それより上流はマイナスとなり下流はプラスになります。

翻訳開始点を０としたら、それより上流はマイナスとなり下流はプラスになります。

深く考えずに、その人が基準を何にしたかではないでしょうか？
論文でもそうです。

お礼

有り難うございました。

きちんと記載すればどちらでも良いのですね。

これで、スッキリして実験に取り組めます。