分離するほど長期間放置した経験はありませんが、それ以前に真っ黒になって味も香りも変わってしまいます。開封後は容器内の空気に触れてしまいますし、未開封でもＰＥＴ容器は酸素を透過するので、酸化が進み色が濃くなります。酸素と光と高い温度は禁物です。
カビなどが繁殖していなければ健康上の害はありませんが、料理が台無しになってしまうので、真っ黒になって味や香りが変わってしまったものは使用を避けたほうが良いでしょう。
しょうゆには「保存料（安息香酸類）」や「酸化防止剤（アスコルビン酸Ｋ＝ビタミンＣ）」など、色々な添加物が許可されています。原材料にアルコールと書いてあれば「日持ち向上剤」として添加されたものです。
スーパーなどに並んでいる家庭用の醤油で、アルコール以外の添加物「保存料」「酸化防止剤」を使用している製品は見たことがありません。「増粘安定剤」「酸味料」「調味料（アミノ酸・核酸・有機酸など）」などを添加してあるのはよほどの粗悪品と考えてよいでしょう。
「甘味料」を添加してあるのは別の意味があります（九州などに多い）。
お礼
味が変。 その通りでした。料理に醤油を使ったら食べられないほど不味かった。 味が変は、もうダメですね。 ありがとうございました。