培養細胞の持つ酵素

質問

今検索対象にしているのはCOS細胞の糖転移酵素なのですが、
培養細胞の持つ酵素群を網羅的に検索する手段ってありませんか？

回答No.2

MIYD

少なくともExPASyからリンクしている2D解析のページにはCOS細胞は無いようですね。
リンク先をチェックしているわけではないので追加されている可能性はありますが。

http://kr.expasy.org/ch2d/2d-index.html

タンパク質のデータベースが見つからないのでしたら、
genechipのデータの方が探しやすいかもしれません。
サプリメントでデータを載せている論文はあると思います。

回答No.1

MIYD

網羅的に検索とはどのような方法(wet、dry)を考えているのでしょうか。

１．SWISS-PROTなどで検索
２．2D－PAGE→糖転移酵素に共通のドメインを認識する抗体を作ってWB
３．アフィニティーカラムなどで精製して同定
４．ヒトcDNAの商業的に購入可能な発現ベクターを全部買って、リコンビナントで作らせて活性の測定

でも、"網羅的"というからには、既知の糖転移の活性が報告されていない全ての酵素についても、いかなる基質、条件でも糖転移活性がないことも示す必要があるかと思います。

補足

本当に丁寧にご回答頂いてありがとうございます。
そしてすいません。誤解を生む書き方をしてしまいました。

お聞きしたかったのは
「実験に拠らず、既に確立された文献情報やゲノムデータベースなどから対象の細胞中に酵素遺伝子が存在するかどうかを簡便に検索する方法はないか」
ということです。

網羅的に、というのは何報もの論文から
「この細胞でこのような酵素活性が見られた」
という例をちまちま探り当てる手間を省いて
一遍に検索する手段は無いか、という意味で書きました。
ややこしいこと書いてゴメンナサイ。